More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2616 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  64.88 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  57.81 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  37.02 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  39.01 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.1 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  35.86 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  34.42 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 304 aa  99.8  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 350 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4528  transcriptional regulator, LysR family  37.26 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  33.85 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2214  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00637243  hitchhiker  0.0000100352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>