More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4528 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4528  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 280 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 338 aa  92.8  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.2 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  32.4 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 303 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  36.98 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2921  LysR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4819  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  27.91 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.83 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  30.23 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  33.59 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  30.23 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2888  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5884  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  24.11 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  24.02 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  27.73 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20370  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.975596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>