More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2135 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
875 aa  638  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
874 aa  675  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
876 aa  649  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.29274e-05  hitchhiker  2.729e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
863 aa  657  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
876 aa  650  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
880 aa  692  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
883 aa  637  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
877 aa  685  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
880 aa  644  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
874 aa  661  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
874 aa  650  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
874 aa  635  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
874 aa  669  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
874 aa  674  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
905 aa  636  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
876 aa  651  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
876 aa  654  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  1.32365e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
876 aa  654  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  3.67228e-05 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
893 aa  849  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
876 aa  668  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
876 aa  652  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
878 aa  703  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
888 aa  654  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
874 aa  671  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
876 aa  650  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 
892 aa  1008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66282e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
892 aa  1018  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
892 aa  657  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
875 aa  652  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
892 aa  1009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 
898 aa  869  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
878 aa  723  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
874 aa  647  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
874 aa  657  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 
897 aa  855  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
874 aa  657  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
874 aa  656  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
880 aa  723  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
876 aa  695  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
863 aa  649  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
892 aa  667  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
874 aa  636  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
876 aa  651  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
876 aa  650  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
878 aa  636  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
880 aa  660  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 
893 aa  989  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
874 aa  653  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
859 aa  644  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
904 aa  864  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
903 aa  639  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  1.35737e-05 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
874 aa  657  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
876 aa  648  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 
888 aa  1083  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
875 aa  644  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
878 aa  664  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
874 aa  647  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
891 aa  890  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
878 aa  717  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
879 aa  664  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
878 aa  667  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 
895 aa  970  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
902 aa  877  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 
893 aa  896  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
879 aa  644  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
890 aa  637  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
900 aa  904  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  80.9 
 
 
889 aa  1366  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
890 aa  897  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
897 aa  821  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 
885 aa  852  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
897 aa  898  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  51.4 
 
 
894 aa  823  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  78.47 
 
 
890 aa  1286  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
895 aa  869  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
882 aa  687  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 
895 aa  957  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
889 aa  1771  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
888 aa  983  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  64 
 
 
889 aa  1112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
889 aa  678  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
880 aa  653  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90216e-06 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
880 aa  652  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
877 aa  656  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
880 aa  641  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
881 aa  645  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
879 aa  643  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
880 aa  656  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
880 aa  653  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
876 aa  650  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
877 aa  656  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
898 aa  925  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86953e-08 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
879 aa  713  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
890 aa  936  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
875 aa  649  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  41.56 
 
 
876 aa  649  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
893 aa  654  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
903 aa  898  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
877 aa  667  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 
896 aa  823  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>