More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1712 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  85.39 
 
 
223 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  82.19 
 
 
219 aa  355  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  80.56 
 
 
233 aa  341  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  77.29 
 
 
233 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  67.74 
 
 
223 aa  301  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  70.18 
 
 
259 aa  300  9e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  69.34 
 
 
218 aa  294  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  67.89 
 
 
219 aa  293  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  67.59 
 
 
217 aa  291  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  63.47 
 
 
224 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  69.52 
 
 
229 aa  289  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  69.34 
 
 
229 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  62.33 
 
 
249 aa  288  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  67.59 
 
 
231 aa  287  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  66.2 
 
 
222 aa  281  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  64.52 
 
 
220 aa  281  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  65.74 
 
 
222 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  65.74 
 
 
222 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  65.74 
 
 
222 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  60.27 
 
 
225 aa  276  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  66.04 
 
 
218 aa  275  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  63.77 
 
 
241 aa  274  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  60 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  64.35 
 
 
221 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  62.5 
 
 
221 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  59.8 
 
 
220 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 
299 aa  250  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  57.14 
 
 
253 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  51.77 
 
 
231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  53.1 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  54.02 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  54.67 
 
 
226 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  52.48 
 
 
231 aa  202  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  49.03 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  36.82 
 
 
220 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 
227 aa  141  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35.94 
 
 
220 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 
218 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  34.56 
 
 
220 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  33.33 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.98 
 
 
221 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.53 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.98 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  36.27 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.62 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.48 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
218 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  31.5 
 
 
215 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.41 
 
 
222 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  25.34 
 
 
221 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 
221 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.84 
 
 
226 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  30.73 
 
 
207 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 
225 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 
221 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.51 
 
 
221 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  31.72 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.86 
 
 
443 aa  91.7  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  31.73 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 
218 aa  88.6  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 
450 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.87 
 
 
626 aa  85.1  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.22 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  29.02 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 
445 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  27.64 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  27.91 
 
 
445 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  28.44 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  24.23 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  29.91 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  25.91 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 
465 aa  78.6  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  30.73 
 
 
449 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.19 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 
449 aa  76.3  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  29.28 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.22 
 
 
467 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  31.46 
 
 
617 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.5 
 
 
630 aa  75.5  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.61 
 
 
457 aa  75.1  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 
448 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 
445 aa  75.1  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  26.05 
 
 
457 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  23.01 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  25.58 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  26.79 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  26.67 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  29.19 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>