282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0024 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  100 
 
 		 465 aa  968    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  68.6 
 
 		 465 aa  689    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.78 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  50.97 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  51.52 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  41.49 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  41.49 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  40.55 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  42.76 
 
 		 462 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  42.76 
 
 		 462 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  41.38 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  44.59 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.13 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.66 
 
 		 455 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  42.6 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  41.59 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.23 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  40.52 
 
 		 547 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  40.26 
 
 		 468 aa  360  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.3 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  40.71 
 
 		 468 aa  359  5e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 		 570 aa  358  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  41.08 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 		 536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  40.17 
 
 		 522 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.96 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  40.92 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  42.32 
 
 		 515 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  41.25 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  41.68 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.7 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  39.01 
 
 		 544 aa  349  7e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  41.39 
 
 		 465 aa  342  8e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 		 536 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  38.15 
 
 		 536 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.88 
 
 		 530 aa  338  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  40.94 
 
 		 531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  40.22 
 
 		 462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.39 
 
 		 490 aa  332  9e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.67 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.04 
 
 		 536 aa  330  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.34 
 
 		 466 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.04 
 
 		 470 aa  329  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.6 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.59 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  41.27 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.27 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  41.27 
 
 		 478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  39.82 
 
 		 485 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  40.35 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.48 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 447 aa  325  7e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.36 
 
 		 480 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.36 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  40.82 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.24 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.3 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  40.63 
 
 		 478 aa  323  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.1 
 
 		 532 aa  322  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  36.12 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  40.82 
 
 		 478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  39.77 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  36.72 
 
 		 467 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  39.55 
 
 		 489 aa  316  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  35.76 
 
 		 466 aa  313  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.64 
 
 		 525 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.12 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  38.64 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  38.99 
 
 		 533 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  38.64 
 
 		 542 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.83 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  36.38 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  37.23 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 		 465 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  37.42 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  36.05 
 
 		 468 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  35.39 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  36.64 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 		 547 aa  286  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  36.85 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  36.85 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  36.42 
 
 		 532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  36.44 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  35.7 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.92 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>