76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2196 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  37.46 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  38.57 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  38.6 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  39.29 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  37.1 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  37.72 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  35.76 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  33.46 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  36.26 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  33.21 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  33.21 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  33.21 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  36.46 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  35.21 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  34.86 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  35.99 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  32.53 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  31.85 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  34.53 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  30.71 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  28.88 
 
 		 283 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  32.87 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  34.05 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  31.49 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  35.58 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  30.71 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  31.23 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  30.9 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  31.93 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  32.97 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  33.1 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  32.63 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  33.57 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  32.27 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  31.8 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  30.88 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  31.21 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  33.45 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  31.65 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  32.17 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  34.04 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  31.06 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  30.82 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  34.26 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  29.79 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  29.53 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  31.91 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  29.15 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  38.63 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  30.43 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  31.43 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  30.31 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  28.28 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  27.78 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  24.65 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  30.89 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  36.22 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  37.04 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  36.25 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3494  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.9 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.11 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.19 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.02 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  36.23 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  40.62 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.25 
 
 		 230 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.06 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>