More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0310 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 233 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  41.58 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  41.58 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  32 
 
 		 306 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  28.7 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  32.74 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 598 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  32.3 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 336 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 244 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 244 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  32.19 
 
 		 239 aa  96.3  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 		 253 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 1015 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 1001 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.92 
 
 		 590 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 201 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 291 aa  86.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 234 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 645 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.52 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.63 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  26.52 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.72 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 626 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.72 
 
 		 409 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  28.52 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  27.73 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0625  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0292231  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  30.19 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  30.19 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  29.78 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.31 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  27.27 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  30.28 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 361 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  28.86 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 		 672 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  28.33 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  35 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  28.33 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  26.67 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  29.91 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  29.39 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>