More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13573 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  100 
 
 
386 aa  790    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  84.97 
 
 
385 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  85.23 
 
 
385 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  85.23 
 
 
385 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  84.72 
 
 
385 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  84.72 
 
 
385 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  77.14 
 
 
390 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  71.09 
 
 
394 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  71.88 
 
 
390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  70.65 
 
 
395 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  71.88 
 
 
390 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  70.13 
 
 
391 aa  534  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  69.35 
 
 
389 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  63.02 
 
 
392 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  62.16 
 
 
389 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  66.58 
 
 
390 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  66.49 
 
 
389 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  56.4 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  47.14 
 
 
385 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  41.34 
 
 
381 aa  279  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  42.36 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  45.28 
 
 
387 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  41.16 
 
 
389 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  41.19 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.08 
 
 
385 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.48 
 
 
388 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.16 
 
 
387 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.14 
 
 
384 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.77 
 
 
378 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  42.15 
 
 
381 aa  235  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.02 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  36.92 
 
 
392 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.55 
 
 
383 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  34.48 
 
 
405 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  36.22 
 
 
396 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.02 
 
 
360 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.42 
 
 
388 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  36.25 
 
 
385 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.68 
 
 
386 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  36.06 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  34.84 
 
 
380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  35.15 
 
 
390 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  36.16 
 
 
383 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32 
 
 
396 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.25 
 
 
385 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.41 
 
 
388 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.9 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.57 
 
 
389 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  36.62 
 
 
453 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.89 
 
 
395 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.71 
 
 
548 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.39 
 
 
550 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.13 
 
 
550 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  35.79 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.13 
 
 
550 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.38 
 
 
383 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.66 
 
 
548 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  33.25 
 
 
379 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.3 
 
 
383 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  35.13 
 
 
394 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.9 
 
 
396 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  33.7 
 
 
379 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  35.25 
 
 
389 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.62 
 
 
393 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.91 
 
 
388 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.91 
 
 
388 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.72 
 
 
379 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.92 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.25 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.51 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.86 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.78 
 
 
381 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  38.16 
 
 
382 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.73 
 
 
390 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  32.16 
 
 
400 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  34.45 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  35.1 
 
 
389 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  31.71 
 
 
541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.91 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  35.87 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  35.58 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  34.79 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35.6 
 
 
402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.98 
 
 
383 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  33.95 
 
 
402 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.76 
 
 
389 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.89 
 
 
389 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.15 
 
 
383 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.73 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  32.01 
 
 
388 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  32.88 
 
 
379 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  33.7 
 
 
382 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.51 
 
 
390 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>