More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12584 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  100 
 
 
330 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.516819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10073  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  83.64 
 
 
330 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0512571 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
220 aa  186  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  40.09 
 
 
249 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.71 
 
 
239 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  41.33 
 
 
249 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.59 
 
 
240 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.54 
 
 
231 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  36.72 
 
 
388 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  38.36 
 
 
244 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.08 
 
 
230 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.97 
 
 
646 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  36.99 
 
 
388 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
254 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
228 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  42.08 
 
 
248 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
264 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  41.33 
 
 
244 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  45.54 
 
 
315 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  42.65 
 
 
223 aa  175  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 
231 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  43.11 
 
 
228 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4546  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
238 aa  175  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0534927  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.38 
 
 
237 aa  175  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  40.35 
 
 
654 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  44.86 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  44.13 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.64 
 
 
232 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  42.86 
 
 
233 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  47.52 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  41.35 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.83 
 
 
234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.52 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.83 
 
 
234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.34 
 
 
644 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  42.92 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  39.19 
 
 
239 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  43.52 
 
 
233 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 
231 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.54 
 
 
228 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  43.12 
 
 
225 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.27 
 
 
647 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  43.12 
 
 
241 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  47.37 
 
 
245 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  46.38 
 
 
243 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  39.53 
 
 
241 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
217 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  43.4 
 
 
227 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 
228 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  40.91 
 
 
225 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
643 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 
286 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  38.29 
 
 
230 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.91 
 
 
225 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
226 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  42.79 
 
 
715 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.08 
 
 
255 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 
235 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  41.46 
 
 
240 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
259 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  41.4 
 
 
221 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  42.22 
 
 
240 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  39.63 
 
 
225 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  45.26 
 
 
248 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.18 
 
 
648 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  40.27 
 
 
222 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
246 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  43.81 
 
 
258 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  42.99 
 
 
266 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.69 
 
 
408 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  43.06 
 
 
652 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  39.55 
 
 
235 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  41.89 
 
 
253 aa  169  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  44.5 
 
 
245 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  39.62 
 
 
237 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1795  ABC transporter related protein  46.94 
 
 
271 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
231 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
226 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  40.57 
 
 
237 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
226 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.23 
 
 
280 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  48.04 
 
 
240 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
262 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  42.15 
 
 
247 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  42.72 
 
 
217 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  40.37 
 
 
225 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
226 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  42.59 
 
 
235 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
234 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
235 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  38.49 
 
 
266 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
224 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  43.12 
 
 
240 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  43.12 
 
 
240 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  43.12 
 
 
240 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>