More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0712 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  87.01 
 
 		 154 aa  253  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1953  Holliday junction resolvase  84.42 
 
 		 154 aa  238  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.464779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  68.83 
 
 		 158 aa  229  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  64.94 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  64.94 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  62.42 
 
 		 157 aa  196  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  59.73 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  61.07 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  60.4 
 
 		 157 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  52.2 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0798  Holliday junction resolvase  53.21 
 
 		 161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.62 
 
 		 167 aa  130  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4457  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.57 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3620  Holliday junction resolvase  44.83 
 
 		 163 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  45 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  40.67 
 
 		 161 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.6 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 182 aa  120  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  36.49 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.13 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.48 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.38 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.59 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.33 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  41.13 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  42.55 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  39.01 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  42.31 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.22 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.22 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  41.84 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.33 
 
 		 192 aa  104  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.91 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 180 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 181 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.76 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 181 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 183 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.01 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.42 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  38.46 
 
 		 188 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.96 
 
 		 184 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 181 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 		 180 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.55 
 
 		 202 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 172 aa  98.2  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 275 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 284 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 180 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 180 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 		 173 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 180 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  29.03 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.57 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.46 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  38.3 
 
 		 192 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.59 
 
 		 199 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.77 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 186 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.73 
 
 		 188 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  39.1 
 
 		 186 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.17 
 
 		 192 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  37.59 
 
 		 192 aa  94  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 182 aa  94  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  35.48 
 
 		 180 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.67 
 
 		 191 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>