256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2903 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  81.37 
 
 		 205 aa  350  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  79.41 
 
 		 205 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  67.32 
 
 		 203 aa  274  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  65.85 
 
 		 203 aa  268  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  66.34 
 
 		 204 aa  268  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  63.24 
 
 		 203 aa  262  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  64.53 
 
 		 209 aa  258  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  62.75 
 
 		 204 aa  258  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  64.22 
 
 		 204 aa  257  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  64.36 
 
 		 209 aa  256  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  64.36 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  64.08 
 
 		 204 aa  254  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  63.11 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  63.73 
 
 		 204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  63.59 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  63.73 
 
 		 204 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  62.14 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  62.14 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  64.88 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  62.25 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  57.71 
 
 		 206 aa  248  6e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  63.24 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  56.93 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  57.35 
 
 		 204 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  61.65 
 
 		 204 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  62.25 
 
 		 207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  55.83 
 
 		 206 aa  241  6e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  59.61 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  62.93 
 
 		 204 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  59.02 
 
 		 205 aa  238  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  59.02 
 
 		 208 aa  238  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  56.59 
 
 		 205 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  58.13 
 
 		 206 aa  234  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  56.59 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  56.1 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  58.65 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  56.59 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  56.59 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  57.07 
 
 		 208 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  57.07 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  56.1 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  52.43 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  48.48 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  49.48 
 
 		 209 aa  184  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  49.03 
 
 		 211 aa  184  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  50.26 
 
 		 209 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  48.06 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  47.78 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  45.37 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  46.24 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  47.87 
 
 		 213 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  54.02 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  54.6 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  44.23 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  41.98 
 
 		 211 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  47.31 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  46.77 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  50 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  38.61 
 
 		 393 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  32.76 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  32.76 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  31.03 
 
 		 385 aa  81.3  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  36.77 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  33.75 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  35.93 
 
 		 388 aa  78.6  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  36.08 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  34.18 
 
 		 550 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.89 
 
 		 381 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  32.26 
 
 		 405 aa  74.7  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  34.57 
 
 		 362 aa  74.7  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  37.86 
 
 		 394 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  34.81 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28.74 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  34.18 
 
 		 427 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  33.51 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  32.26 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  28.88 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  27.59 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  28.74 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  35.71 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  31.35 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  29.05 
 
 		 384 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  33.33 
 
 		 386 aa  68.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  30.25 
 
 		 386 aa  68.2  0.00000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  31.01 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  27.59 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  32.08 
 
 		 385 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  31.9 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  27.93 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  31.45 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  31.45 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  31.45 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  31.45 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  31.85 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>