More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0634 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 453 aa  895    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  72.44 
 
 		 408 aa  565  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  67.09 
 
 		 247 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  64.63 
 
 		 245 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  60 
 
 		 260 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  61.74 
 
 		 261 aa  233  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  75.37 
 
 		 136 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  57.32 
 
 		 233 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  73.88 
 
 		 135 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.63 
 
 		 139 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.81 
 
 		 139 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.13 
 
 		 135 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.99 
 
 		 138 aa  208  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.22 
 
 		 150 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.44 
 
 		 150 aa  204  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  71.97 
 
 		 148 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  75.78 
 
 		 136 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.07 
 
 		 141 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  69.34 
 
 		 141 aa  196  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  67.18 
 
 		 140 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  69.53 
 
 		 147 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.16 
 
 		 135 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  69.53 
 
 		 137 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  68.75 
 
 		 143 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  66.41 
 
 		 215 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.67 
 
 		 139 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  68.7 
 
 		 136 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  53.14 
 
 		 232 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  67.69 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  67.19 
 
 		 294 aa  183  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  48 
 
 		 235 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  64.89 
 
 		 136 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  64.06 
 
 		 222 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  52.05 
 
 		 232 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  52.25 
 
 		 235 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  48.67 
 
 		 232 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  50.45 
 
 		 234 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  65.12 
 
 		 223 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  52.22 
 
 		 248 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  62.12 
 
 		 136 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  50 
 
 		 234 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  64.84 
 
 		 217 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  64.84 
 
 		 217 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  64.84 
 
 		 217 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  49.32 
 
 		 232 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  51.71 
 
 		 233 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  62.59 
 
 		 157 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  63.43 
 
 		 225 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  50.72 
 
 		 233 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  68.38 
 
 		 138 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  63.28 
 
 		 225 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  52.68 
 
 		 219 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  50.94 
 
 		 235 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  50.72 
 
 		 223 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  50.48 
 
 		 271 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  50.71 
 
 		 232 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  56.35 
 
 		 144 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.69 
 
 		 227 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.09 
 
 		 227 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.3 
 
 		 219 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  53.03 
 
 		 135 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 337 aa  143  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  44.89 
 
 		 294 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  46.91 
 
 		 222 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 		 137 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.79 
 
 		 130 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  48.18 
 
 		 147 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  51.97 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  47.33 
 
 		 174 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  42.91 
 
 		 246 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  44.76 
 
 		 246 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  44.19 
 
 		 133 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 		 148 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  54.33 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  48.33 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  45.31 
 
 		 132 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.76 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.7 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  46.09 
 
 		 131 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  43.41 
 
 		 131 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 142 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  45.11 
 
 		 138 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.31 
 
 		 147 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 		 140 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.94 
 
 		 151 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.3 
 
 		 140 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 		 145 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  41.43 
 
 		 146 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 139 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  38.76 
 
 		 138 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  42.97 
 
 		 130 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  39.37 
 
 		 132 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  39.37 
 
 		 132 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  47.15 
 
 		 132 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 137 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  40.58 
 
 		 141 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  42.62 
 
 		 125 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 134 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.18 
 
 		 143 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>