More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1822 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 
379 aa  765    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.89 
 
 
391 aa  297  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  39.46 
 
 
363 aa  278  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  39.46 
 
 
363 aa  277  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  35.79 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  35.79 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  35.34 
 
 
376 aa  219  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  30.46 
 
 
372 aa  192  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  30.35 
 
 
366 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  28.84 
 
 
372 aa  188  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  32.25 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  32.25 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  27.96 
 
 
375 aa  182  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  28.73 
 
 
369 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  29.38 
 
 
379 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  28.95 
 
 
370 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  27.99 
 
 
368 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  27.72 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.09 
 
 
396 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  27.13 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  27.96 
 
 
369 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  26.2 
 
 
385 aa  139  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  27.45 
 
 
367 aa  133  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  26.61 
 
 
710 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  30 
 
 
365 aa  129  6e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  24.54 
 
 
401 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.88 
 
 
361 aa  99  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  22.13 
 
 
604 aa  95.9  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  29.07 
 
 
278 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  28.86 
 
 
597 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 
669 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  26.22 
 
 
560 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  30.99 
 
 
254 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  22.28 
 
 
465 aa  56.2  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  26.2 
 
 
458 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 
717 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  25 
 
 
442 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  23.81 
 
 
534 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  26.44 
 
 
465 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  26.44 
 
 
465 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0179  tRNA modification GTPase TrmE  35.48 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  29.31 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  21.71 
 
 
281 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  25.29 
 
 
465 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  23.28 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  26.2 
 
 
437 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  32.5 
 
 
478 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  22.62 
 
 
281 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  25.95 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  21.2 
 
 
465 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  29.47 
 
 
468 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  32.84 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  25 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  28.24 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  23.84 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  24.76 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  35.8 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  25.3 
 
 
443 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  24.31 
 
 
441 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  23.36 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 
433 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  30.69 
 
 
441 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  30.3 
 
 
470 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  22.29 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  27.22 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  28.18 
 
 
494 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  23.64 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  22.06 
 
 
285 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  37.33 
 
 
461 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  28.92 
 
 
280 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  25.14 
 
 
463 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  39.06 
 
 
463 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 
457 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  23.85 
 
 
436 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  20.31 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  32.68 
 
 
260 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  25.27 
 
 
441 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  25.29 
 
 
287 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  24.47 
 
 
437 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  32.05 
 
 
444 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  24.28 
 
 
287 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  28.19 
 
 
262 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 
458 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 
442 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  28.19 
 
 
262 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  37.88 
 
 
496 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  24.19 
 
 
438 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 
461 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  24.52 
 
 
277 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>