More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0396 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  100 
 
 
254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  65.12 
 
 
258 aa  338  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  39.52 
 
 
268 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  40.23 
 
 
374 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  40.71 
 
 
374 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  36.9 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  40.65 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  40.32 
 
 
388 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  40 
 
 
384 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  39.04 
 
 
265 aa  144  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  37.94 
 
 
379 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  35.68 
 
 
261 aa  138  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  36.14 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  32.66 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.26 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  31.7 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  33.2 
 
 
534 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  33.73 
 
 
560 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  31.1 
 
 
443 aa  101  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  29.7 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  27.9 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  29.72 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  32.16 
 
 
717 aa  94  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  30.71 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  31.1 
 
 
562 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  29.96 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  28.14 
 
 
544 aa  90.1  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  30.47 
 
 
314 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  25.85 
 
 
521 aa  90.1  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  29.69 
 
 
312 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  29.04 
 
 
287 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  29.69 
 
 
312 aa  88.6  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  30.38 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  29.69 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  27.78 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  28.78 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  29.41 
 
 
312 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  27.24 
 
 
279 aa  85.5  7e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  31.23 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  28.12 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  29.13 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  29.69 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  28.12 
 
 
318 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.45 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 
669 aa  83.6  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  26.98 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  28.83 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  28.35 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  27.57 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  28.74 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.7 
 
 
292 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  27.6 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  27.61 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  29.64 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  28.67 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  29.02 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  27.24 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  26.88 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  27.6 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  27.6 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  27.5 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  27.5 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  27.6 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  26.46 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  27.6 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  24.53 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  29.02 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  27.73 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  28.63 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  28.63 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  27.59 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  28.41 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  26.09 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  26.09 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  28.95 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  26.34 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 
313 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  27.55 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  28.17 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  25.4 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  28.52 
 
 
597 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  29.3 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  27.1 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  27.17 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  28.17 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  24.52 
 
 
378 aa  75.5  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  29.13 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  24.07 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  27.11 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  26.79 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  26.48 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  23.28 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.9 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  26.85 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  28.12 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>