More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3055 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  100 
 
 
258 aa  522  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  65.12 
 
 
254 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  39.45 
 
 
374 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  40.54 
 
 
384 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  40.15 
 
 
374 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  40.15 
 
 
388 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  38.61 
 
 
268 aa  152  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  39.84 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  37.7 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  34.65 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  35.91 
 
 
379 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  37.3 
 
 
256 aa  136  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  36.11 
 
 
259 aa  131  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  38.67 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.94 
 
 
267 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  31 
 
 
287 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  29.35 
 
 
544 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  28.79 
 
 
282 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  30.42 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  29.76 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  29.21 
 
 
291 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  30.63 
 
 
284 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  29.88 
 
 
443 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  30.15 
 
 
280 aa  94  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  26.46 
 
 
521 aa  92  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  29.1 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  28.78 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  28.78 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  30.08 
 
 
323 aa  88.6  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  26.91 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  28.03 
 
 
312 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  30.67 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  30.16 
 
 
717 aa  87  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  28.91 
 
 
534 aa  85.9  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  25.1 
 
 
284 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  30.43 
 
 
560 aa  85.5  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  27.34 
 
 
292 aa  85.5  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  27.76 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  27.84 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  28.24 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  27.63 
 
 
312 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  26.05 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  28.15 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  28.15 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  28.15 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  28.21 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  26.89 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  27.41 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  27.41 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  26.12 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  28.1 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  29.26 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  25.97 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  27.17 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  27.17 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  28.15 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  26.67 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  28.15 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  27.76 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  26.84 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  27.41 
 
 
296 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  26.17 
 
 
305 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  29.2 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  27.76 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  25.63 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.66 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  29.73 
 
 
562 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  29.17 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  33.33 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  29.7 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.37 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  25.62 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  26.54 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  29.15 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  27.5 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  26.95 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 
669 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  25.48 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  27.72 
 
 
597 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  28.19 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.57 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  25.94 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  27.6 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  27.6 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  26.27 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  30.22 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  27.8 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  27.01 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  27.01 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  27.01 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  26.79 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  27.8 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  27.24 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  33.92 
 
 
650 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  25.69 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  29.51 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  26.34 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  26.64 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  26.84 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  25.29 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>