209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1645 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 267 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  55.09 
 
 		 265 aa  298  5e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  39.69 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  36.4 
 
 		 388 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  36.4 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  37.13 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  38.91 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  34.47 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  37.27 
 
 		 379 aa  142  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  36.08 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  35.06 
 
 		 374 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  36.71 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  33.68 
 
 		 521 aa  122  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  32.26 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  31.11 
 
 		 443 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  31.07 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 669 aa  112  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  28.67 
 
 		 534 aa  112  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  32.94 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  30.64 
 
 		 544 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  30.36 
 
 		 562 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  35.08 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 		 717 aa  102  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  32.03 
 
 		 560 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  30.19 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  29.21 
 
 		 597 aa  96.3  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  30.45 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  30.77 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  29.85 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  27 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  28.68 
 
 		 305 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  29.63 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  31.09 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  30.71 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  28.62 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  24.68 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  30.16 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.97 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  28.68 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  28.68 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  25.38 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  26.97 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  26.42 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  30.19 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  29.63 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  27.8 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  28.04 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  26.59 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.78 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  27.44 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  27.86 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  27.44 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  25.28 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  27.34 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  27.8 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  27.8 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  24.73 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  29.74 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  27.03 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  27.03 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  27.03 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  27.47 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  27.03 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  27.03 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  29.43 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  27.41 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  28.24 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  32.54 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  26.59 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  25.28 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  33.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  32.54 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  30.3 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  31.25 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  25.47 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  24.91 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  24.81 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  27.86 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  26.97 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  27.16 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  25.1 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  30.06 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  27.49 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  29.57 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  27.49 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  25.56 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  27.07 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  27.27 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  28.03 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  25.69 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  26.47 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>