286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1931 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  100 
 
 		 265 aa  530  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  55.09 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  38.76 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  37.97 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  37.84 
 
 		 374 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  37.89 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  37.07 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  37.07 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  37.07 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  41.86 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  39.04 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  37.11 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  37.31 
 
 		 379 aa  149  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  38.67 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  30.59 
 
 		 521 aa  135  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  31.49 
 
 		 669 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  35.71 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  33.91 
 
 		 360 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  36.47 
 
 		 560 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  31.82 
 
 		 544 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  31.82 
 
 		 443 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  32.32 
 
 		 597 aa  108  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  31.64 
 
 		 534 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  29.46 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 		 717 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  29.24 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  30.27 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  30.74 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  32.21 
 
 		 562 aa  99  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  27.63 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  28.62 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  25.65 
 
 		 291 aa  95.5  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  25.71 
 
 		 378 aa  93.2  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  28.52 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  27.31 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  27.31 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  27.31 
 
 		 318 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  26.77 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  27.34 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  26.54 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  26.35 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  28.03 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  29.46 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  30.42 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  30.42 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  26.53 
 
 		 288 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  28.03 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  26.88 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  32.14 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  25.58 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  24.78 
 
 		 653 aa  82.4  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  31.1 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  26.67 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  27.61 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  26.14 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  31.44 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  26.36 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  25.58 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  28.82 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  30.48 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.68 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  30.81 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  27.14 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  27.67 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.06 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  29.35 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  28.32 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  26.72 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  25.24 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  26.41 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  26.36 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  26.24 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  27.62 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  28.12 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  26.62 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  25.97 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  31.4 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  31.4 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  25.71 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  25.97 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  25.97 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  26.89 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  23.25 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  27.04 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  24.81 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  30.23 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.27 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  30.23 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  30.23 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  30.23 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  24.81 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  30.23 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  30.23 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  26.25 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  26.25 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  26.25 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  26.25 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  26.25 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  26.52 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  26.84 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>