More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1049 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  100 
 
 
256 aa  497  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  81.64 
 
 
259 aa  429  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  80.08 
 
 
261 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  78.12 
 
 
268 aa  413  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  50.59 
 
 
261 aa  188  9e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  37.35 
 
 
374 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  37.21 
 
 
384 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  36.96 
 
 
388 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  37.11 
 
 
265 aa  149  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.91 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  36.84 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  35.41 
 
 
374 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  37.3 
 
 
258 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  36.14 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  35.27 
 
 
560 aa  128  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  33.33 
 
 
379 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  34.17 
 
 
288 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  32.75 
 
 
360 aa  122  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  33.21 
 
 
717 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  29.92 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  33.7 
 
 
534 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  30.11 
 
 
597 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  30.71 
 
 
443 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  32.66 
 
 
544 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  32.68 
 
 
669 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  30.4 
 
 
292 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  31.19 
 
 
521 aa  112  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  30.14 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  34.44 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  34.77 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 
296 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 
296 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 
296 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 
296 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 
296 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 
296 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 
296 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 
296 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  30.5 
 
 
296 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  28.62 
 
 
291 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  30.12 
 
 
287 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  32.21 
 
 
287 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  30.22 
 
 
314 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  31.48 
 
 
562 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  33.72 
 
 
328 aa  101  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.94 
 
 
285 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  32.83 
 
 
270 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  32.44 
 
 
305 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  30.12 
 
 
296 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  28.99 
 
 
315 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  32.96 
 
 
278 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  30.71 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  31.18 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  30.6 
 
 
311 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  32.23 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  32.35 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 
277 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  28.31 
 
 
653 aa  94.7  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  28.41 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  27.94 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  31.06 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  29.48 
 
 
314 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  31.84 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  29.43 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  29.43 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  29.2 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  31.92 
 
 
305 aa  92.8  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  32.85 
 
 
317 aa  92.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  28.36 
 
 
281 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  30.08 
 
 
314 aa  92.4  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  28.36 
 
 
281 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  27.17 
 
 
310 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  29.06 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  29.93 
 
 
320 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  31.85 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  29.01 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  28.41 
 
 
312 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  28.41 
 
 
312 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  29.55 
 
 
313 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  35.9 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  28.69 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  28.69 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  29.06 
 
 
313 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  30.58 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  31.85 
 
 
304 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  27.65 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  27.65 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  28.04 
 
 
378 aa  89.4  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  33.46 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  29.73 
 
 
299 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  35.71 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  27.88 
 
 
281 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  30.16 
 
 
258 aa  88.6  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  28.74 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.95 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  33.53 
 
 
283 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  30.37 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  29.17 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  30.3 
 
 
319 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  27.78 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>