245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_2179 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  100 
 
 		 378 aa  776    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  45.8 
 
 		 650 aa  352  5.9999999999999994e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  44.24 
 
 		 653 aa  327  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  41.9 
 
 		 529 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  47.59 
 
 		 743 aa  171  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  30.28 
 
 		 597 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  27.27 
 
 		 534 aa  132  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06180  GTPase, putative  26.48 
 
 		 638 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15435  predicted protein  31.67 
 
 		 611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183176  normal  0.664844 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 		 717 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  26.69 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 669 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  30.99 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  23.3 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  28.05 
 
 		 521 aa  106  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  30.06 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  28.48 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  24.29 
 
 		 562 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  25.42 
 
 		 291 aa  94  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  25.93 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  27.85 
 
 		 261 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  28.04 
 
 		 256 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  25.78 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  25.58 
 
 		 280 aa  86.7  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.68 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  24.69 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  25.23 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  25.62 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  27.42 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  27.23 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  27.23 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  23.78 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  25.97 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  24.52 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  25 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.53 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  26.79 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  25.55 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  27.8 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  22.59 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  27.75 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.06 
 
 		 271 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  26.92 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  26.69 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  25.77 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  26.92 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  26.69 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  26.92 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  26.37 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.08 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  28.23 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  26.6 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.16 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  25.96 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.3 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  26.6 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  26.6 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  23.87 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  23.67 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  25.55 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  26.49 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  24.92 
 
 		 281 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  24.11 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  24.6 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  25.32 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  24.28 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  24.01 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  28.37 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  24.11 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  23.42 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  22.51 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  22.51 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  26.63 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  23.78 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  24.75 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  25.85 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  24.46 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  23.61 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  25.85 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  25.78 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  23.51 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  23.71 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  22.1 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  22.32 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  27.14 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  22.9 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  23.32 
 
 		 258 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  24.53 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  20.26 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  25.84 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  29.05 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  25.84 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  25.65 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2458  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  25.65 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  25.65 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  23.5 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  22.32 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  36.25 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  24.92 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>