More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8832 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 210 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  64.08 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 242 aa  228  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  60.37 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  58.96 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  57.73 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  53.81 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  41.55 
 
 		 240 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 222 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  41.44 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 248 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  40.45 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  37.24 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  39.33 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  39.33 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  36.57 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 244 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 242 aa  95.1  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  36.81 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  33.12 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  33.12 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.32 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  32.7 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  34.03 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.76 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  33.97 
 
 		 254 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 249 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 249 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  40.78 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  35.92 
 
 		 257 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  35.81 
 
 		 277 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  36.18 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  33.56 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  33.79 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  33.79 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  33.79 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  33.79 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  30.9 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  33.79 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  33.79 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  33.79 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  26.39 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.75 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  30.41 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.1 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  32.89 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  32.19 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  32.19 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  32.19 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  32.19 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  32.19 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  28.57 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>