More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7493 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  100 
 
 
564 aa  1126    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  37.37 
 
 
545 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  34.72 
 
 
568 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  32.01 
 
 
557 aa  283  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  34.57 
 
 
546 aa  279  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  35.28 
 
 
549 aa  277  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  34.34 
 
 
543 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  32.22 
 
 
539 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  33.81 
 
 
543 aa  264  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  32.86 
 
 
564 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  35.41 
 
 
541 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  33.8 
 
 
564 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  34.42 
 
 
542 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  34.04 
 
 
532 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  31.77 
 
 
583 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.81 
 
 
574 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
538 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7512  metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold-like protein  42.66 
 
 
462 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  32.61 
 
 
573 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  32.11 
 
 
603 aa  225  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  34.68 
 
 
548 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.98 
 
 
537 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.25 
 
 
542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.98 
 
 
533 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.42 
 
 
520 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31 
 
 
573 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  32.98 
 
 
569 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  32.17 
 
 
601 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  31.25 
 
 
608 aa  217  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  31.18 
 
 
613 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.67 
 
 
584 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  33.52 
 
 
549 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  31.67 
 
 
604 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.51 
 
 
556 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  31.94 
 
 
569 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.92 
 
 
569 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  32.39 
 
 
576 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.66 
 
 
556 aa  210  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.75 
 
 
553 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.88 
 
 
616 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  30.94 
 
 
564 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  30.05 
 
 
581 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.91 
 
 
530 aa  207  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.41 
 
 
535 aa  206  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  31.91 
 
 
527 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.04 
 
 
548 aa  204  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.24 
 
 
543 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
565 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.61 
 
 
560 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  31.13 
 
 
581 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.34 
 
 
537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.97 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.33 
 
 
543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  31.86 
 
 
648 aa  198  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.18 
 
 
545 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.79 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.48 
 
 
539 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  30.03 
 
 
587 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 
527 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.45 
 
 
541 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.93 
 
 
583 aa  192  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  29.79 
 
 
592 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  30.22 
 
 
589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  32.05 
 
 
650 aa  189  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  32.94 
 
 
520 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.27 
 
 
544 aa  189  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  30.09 
 
 
563 aa  187  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  30.26 
 
 
543 aa  187  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 
512 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  30.29 
 
 
606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  29.51 
 
 
537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.58 
 
 
583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.58 
 
 
583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.27 
 
 
556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.22 
 
 
547 aa  183  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  30.23 
 
 
533 aa  183  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.31 
 
 
579 aa  183  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  30.03 
 
 
576 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  28.67 
 
 
560 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 
550 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  31.44 
 
 
537 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.19 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.39 
 
 
575 aa  181  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.43 
 
 
541 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 
543 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  30.59 
 
 
550 aa  180  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.21 
 
 
575 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  28.55 
 
 
536 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  28.55 
 
 
536 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  28.55 
 
 
536 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
560 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.76 
 
 
601 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.43 
 
 
565 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 
522 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  26.74 
 
 
546 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  28.1 
 
 
585 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.83 
 
 
556 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  28.92 
 
 
656 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  32.7 
 
 
574 aa  177  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.27 
 
 
540 aa  176  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>