More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6569 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  100 
 
 
394 aa  796    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  79 
 
 
382 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  76.68 
 
 
387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  66.32 
 
 
393 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  65.13 
 
 
391 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.67 
 
 
387 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  65.01 
 
 
400 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  67.45 
 
 
381 aa  494  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  64.87 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  64.86 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  64.49 
 
 
387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  59.32 
 
 
384 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.84 
 
 
385 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  60.41 
 
 
413 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  60.67 
 
 
395 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  54.5 
 
 
391 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  57.33 
 
 
389 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  58.64 
 
 
386 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  54.29 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  54.03 
 
 
391 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  56.81 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  58.78 
 
 
401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  54.81 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  54.81 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.53 
 
 
413 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  58.33 
 
 
421 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  54.92 
 
 
409 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  52.55 
 
 
397 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  57.87 
 
 
402 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.99 
 
 
402 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.03 
 
 
387 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  53.62 
 
 
397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  53.64 
 
 
388 aa  358  8e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  51.07 
 
 
383 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  48.68 
 
 
387 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  48.94 
 
 
388 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 
395 aa  342  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.2 
 
 
408 aa  342  9e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  47.58 
 
 
387 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
392 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  49.1 
 
 
395 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  46.75 
 
 
385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  50.53 
 
 
384 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  48.07 
 
 
397 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  46.77 
 
 
384 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  47.2 
 
 
384 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  46.51 
 
 
384 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  48.41 
 
 
394 aa  324  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  49.73 
 
 
383 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  48.8 
 
 
383 aa  319  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  47.73 
 
 
394 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  48.25 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  48.4 
 
 
409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  47.62 
 
 
394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  47.35 
 
 
394 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.03 
 
 
417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  47.27 
 
 
398 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  40 
 
 
393 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  44.65 
 
 
399 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  43.34 
 
 
390 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  42.6 
 
 
382 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  47.72 
 
 
391 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  42.01 
 
 
385 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  43.08 
 
 
390 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  43.93 
 
 
390 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  43.81 
 
 
389 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  42.37 
 
 
385 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  43.08 
 
 
382 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  43.72 
 
 
390 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  43.68 
 
 
396 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  43.98 
 
 
384 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  43.98 
 
 
391 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  43.98 
 
 
391 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  43.98 
 
 
391 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  43.98 
 
 
391 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  43.98 
 
 
391 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  44.42 
 
 
389 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  42.93 
 
 
382 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  43.72 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  42.93 
 
 
382 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  42.3 
 
 
382 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  42.71 
 
 
382 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  41.73 
 
 
379 aa  289  8e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  41.75 
 
 
385 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  43.31 
 
 
382 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  43.27 
 
 
383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.89 
 
 
390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  42.63 
 
 
390 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  44.95 
 
 
391 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.89 
 
 
390 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  42.3 
 
 
382 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  41.05 
 
 
386 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.89 
 
 
390 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.63 
 
 
390 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.89 
 
 
390 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  41.98 
 
 
386 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  41.98 
 
 
386 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  40.79 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  43.56 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  43.67 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>