221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0889 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 99 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  85.86 
 
 		 99 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  52.53 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  42.53 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  35.37 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  34.09 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  34.09 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.33 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2542  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.054294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  34.15 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  43.08 
 
 		 188 aa  50.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.33 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  32.18 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  53.57 
 
 		 503 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  33.9 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  33.9 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  33.9 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 266 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  33.9 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  33.9 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  39.44 
 
 		 465 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 346 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  34.94 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  31.33 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.11 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  31.33 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 513 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 361 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2246  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  35.62 
 
 		 264 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1826  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  32.1 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  44.44 
 
 		 516 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  32.1 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 219 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 202 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  33.9 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>