More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1281 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  100 
 
 
410 aa  852  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  57.87 
 
 
408 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  55.84 
 
 
419 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  56.35 
 
 
422 aa  482  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  57.11 
 
 
414 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  56.35 
 
 
415 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  55.58 
 
 
418 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  57.95 
 
 
417 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  56.78 
 
 
412 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  57.76 
 
 
415 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  55.84 
 
 
409 aa  471  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  56.09 
 
 
415 aa  468  1e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  56.35 
 
 
413 aa  471  1e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  54.31 
 
 
418 aa  466  1e-130  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  53.69 
 
 
418 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  53.81 
 
 
416 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  53.3 
 
 
413 aa  446  1e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  53.28 
 
 
414 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  54.95 
 
 
408 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  50.13 
 
 
410 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  51.65 
 
 
411 aa  406  1e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  51.65 
 
 
411 aa  406  1e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  48.52 
 
 
409 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  50.89 
 
 
411 aa  400  1e-110  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  49.75 
 
 
411 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  50.63 
 
 
416 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  47.85 
 
 
413 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  50.89 
 
 
416 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  47.59 
 
 
395 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  47.1 
 
 
397 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  46.45 
 
 
398 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  46.56 
 
 
403 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  45.43 
 
 
413 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  46.02 
 
 
402 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  45.64 
 
 
399 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  46.12 
 
 
413 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  45.38 
 
 
416 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  43.75 
 
 
423 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  43.61 
 
 
409 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  43.61 
 
 
409 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  43.61 
 
 
436 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  43.54 
 
 
413 aa  340  3e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  43.78 
 
 
418 aa  335  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  39.2 
 
 
404 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  38.94 
 
 
404 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  38.94 
 
 
404 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  37.24 
 
 
396 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.47 
 
 
394 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.21 
 
 
394 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  38.13 
 
 
404 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  37.98 
 
 
396 aa  292  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  37.31 
 
 
402 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  38.14 
 
 
389 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  36.79 
 
 
404 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  37.98 
 
 
394 aa  285  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  36.16 
 
 
448 aa  285  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  37.98 
 
 
394 aa  285  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  36.72 
 
 
404 aa  284  2e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  38.08 
 
 
397 aa  284  2e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  36.53 
 
 
404 aa  284  2e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  37.47 
 
 
417 aa  283  5e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  38.66 
 
 
396 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  36.6 
 
 
395 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  8.24162e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  36.29 
 
 
410 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  38.08 
 
 
391 aa  279  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  36.56 
 
 
421 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  35.57 
 
 
404 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 
387 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  37.5 
 
 
391 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  37.76 
 
 
409 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  37.85 
 
 
401 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.25 
 
 
402 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  36.62 
 
 
394 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  35.98 
 
 
419 aa  269  6e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  35.98 
 
 
419 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  36.27 
 
 
396 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  34.8 
 
 
449 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  37.44 
 
 
393 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  37.5 
 
 
404 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  37.53 
 
 
402 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.57829e-05 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  34.91 
 
 
438 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  35.96 
 
 
412 aa  259  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  35.4 
 
 
404 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.19 
 
 
402 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  36.57 
 
 
401 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  34.45 
 
 
404 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  34.96 
 
 
404 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  34.96 
 
 
404 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  35.57 
 
 
401 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  36.03 
 
 
387 aa  255  1e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  36.52 
 
 
423 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.57 
 
 
422 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  34.45 
 
 
391 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  34.76 
 
 
413 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  37.06 
 
 
407 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  37.43 
 
 
367 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  34.01 
 
 
394 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  33.68 
 
 
404 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  36.41 
 
 
406 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  34.87 
 
 
406 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>