More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0616 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 344 aa  718    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 353 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  34.74 
 
 		 353 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 353 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 337 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  34.39 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4268  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1230  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.593917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  31.45 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  28.48 
 
 		 348 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  24.78 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  25 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  28.35 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 366 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  27.58 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 366 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  23.72 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  24.02 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  25.93 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.44 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  25.96 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 347 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.52 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  23.2 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  25.96 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>