More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2894 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  68.62 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  68.28 
 
 		 291 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  71.38 
 
 		 291 aa  349  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  54.92 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  55.05 
 
 		 299 aa  291  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  55.52 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  57.29 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  51.68 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  56.14 
 
 		 300 aa  279  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  52.65 
 
 		 296 aa  278  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  52.58 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  52.23 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  50.67 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  50.35 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  58.45 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  58.45 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  52.76 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  52.76 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  52.76 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  52.74 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  52.76 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  49.3 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  52.76 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  52.76 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  52.36 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  48.95 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  52.76 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  48.94 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  48.94 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  48.94 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  52.74 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  49.31 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  50 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  52.4 
 
 		 294 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  52.05 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  49.12 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  52.05 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  52.05 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  54.45 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  52.76 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  51.38 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  49.3 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  53.58 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  55.28 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  54.33 
 
 		 295 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  54.83 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  52.26 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  55.89 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  53.98 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  52.41 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  54.95 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2427  Polyprenyl synthetase  56.11 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  51.69 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  57.51 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  47.86 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  56.45 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2222  geranyltranstransferase  57.71 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  55.32 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0881  farnesyl-diphosphate synthase  55.67 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  49.65 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  53.63 
 
 		 295 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2034  Polyprenyl synthetase  56.86 
 
 		 303 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 293 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  48.04 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  52.98 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  42.67 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  53.77 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  56.98 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  56.98 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  56.98 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  56.98 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  56.98 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  50.69 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  55.28 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  56.6 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  45.67 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  51.92 
 
 		 298 aa  244  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  53.41 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  51.02 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  51.02 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  53.04 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  52.23 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  46.91 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.23 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  56.1 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  45.86 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  56.06 
 
 		 299 aa  241  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01426  geranyltranstransferase  52.36 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.631666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  52.94 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  52.94 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  52.96 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  56.55 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  51.7 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.18 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  45.89 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  51.04 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>