More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5920 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
438 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  68.11 
 
 
438 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  52.07 
 
 
430 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  50 
 
 
438 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  46.62 
 
 
444 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  44.24 
 
 
444 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  40.36 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  40.09 
 
 
447 aa  310  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  38.63 
 
 
440 aa  299  7e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  36.7 
 
 
469 aa  289  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  35.75 
 
 
453 aa  272  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.53 
 
 
453 aa  266  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  35.41 
 
 
446 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  37.72 
 
 
453 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  35.6 
 
 
453 aa  261  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.45 
 
 
439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  33.7 
 
 
453 aa  249  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.18 
 
 
454 aa  249  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  32.89 
 
 
439 aa  199  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  31.15 
 
 
446 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.68 
 
 
441 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.63 
 
 
446 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  27.67 
 
 
466 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  29.25 
 
 
469 aa  170  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.02 
 
 
480 aa  169  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  27.75 
 
 
494 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.12 
 
 
463 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.21 
 
 
455 aa  161  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.57 
 
 
456 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.04 
 
 
456 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.68 
 
 
453 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  29.59 
 
 
461 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  30.32 
 
 
438 aa  159  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 
463 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.73 
 
 
463 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.73 
 
 
463 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 
463 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.73 
 
 
463 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 
463 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  27.94 
 
 
456 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.04 
 
 
462 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.12 
 
 
461 aa  156  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.63 
 
 
450 aa  156  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  29.09 
 
 
428 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  29.63 
 
 
463 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  27.04 
 
 
462 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  28.87 
 
 
456 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.94 
 
 
463 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.27 
 
 
444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.29 
 
 
455 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.04 
 
 
456 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.04 
 
 
448 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.14 
 
 
444 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  29.3 
 
 
452 aa  152  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.3 
 
 
452 aa  152  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.49 
 
 
444 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  28.15 
 
 
461 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  28.6 
 
 
456 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  28.6 
 
 
456 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.97 
 
 
456 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  27.33 
 
 
450 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.63 
 
 
455 aa  149  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.96 
 
 
456 aa  149  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  29.48 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.06 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  27.94 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.24 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  28.24 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.24 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  27.25 
 
 
448 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  27.49 
 
 
452 aa  147  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  28.44 
 
 
451 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  28.9 
 
 
456 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.24 
 
 
456 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  29.04 
 
 
451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.12 
 
 
450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.98 
 
 
450 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.39 
 
 
456 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  30.02 
 
 
450 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  30.02 
 
 
450 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  28.45 
 
 
452 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  30.02 
 
 
450 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.21 
 
 
456 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  30.02 
 
 
450 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.27 
 
 
445 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  29.7 
 
 
450 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  26.48 
 
 
456 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  28.76 
 
 
443 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.27 
 
 
456 aa  143  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  29.49 
 
 
450 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.77 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  26.98 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  27.71 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  26.09 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  30.07 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  28.69 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  27.99 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.08 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.85 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  27.67 
 
 
463 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>