166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2597 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  99.34 
 
 		 452 aa  885    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  889    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  97.79 
 
 		 452 aa  827    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.82 
 
 		 438 aa  568  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58.85 
 
 		 441 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  57.67 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  60.71 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  55.27 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  50 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  50 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  50 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  49.77 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  49.77 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  49.44 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  50.45 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  50.9 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  50.9 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  50.9 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  49.1 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  47.83 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  48.76 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  48.99 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  44.16 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  44.73 
 
 		 419 aa  346  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  49.65 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  42.59 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  44.21 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  43.44 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  42.33 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  44.84 
 
 		 408 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  43.9 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  40.88 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  46.21 
 
 		 413 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  44.77 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  44.5 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  45.71 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  41 
 
 		 429 aa  286  7e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  44.17 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  40.77 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  34.78 
 
 		 1140 aa  219  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  32.17 
 
 		 436 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.98 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.86 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  34.73 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.03 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.27 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.49 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  31.31 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  31.07 
 
 		 425 aa  180  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  33.56 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  31.09 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  33.56 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  33.18 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  35.13 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.56 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.22 
 
 		 431 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  32.71 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  31.14 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  34.45 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  34.28 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  31.77 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  31.93 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  31.77 
 
 		 431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.01 
 
 		 415 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  32.15 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  32.37 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  31.25 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  30.84 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  31.9 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.23 
 
 		 421 aa  166  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 		 389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  32.81 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  31.12 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  29.86 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  31.75 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.41 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  30.34 
 
 		 429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 		 413 aa  140  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  31.19 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  30 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.89 
 
 		 412 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  28.64 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  30.86 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  26.48 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  26.48 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  26.48 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  26.48 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  26.48 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  27.27 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>