More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0125 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  99.36 
 
 
936 aa  1896  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  3.43135e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  56.44 
 
 
965 aa  1020  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  53.91 
 
 
938 aa  935  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  56.67 
 
 
938 aa  1019  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  56.91 
 
 
951 aa  998  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  9.86058e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  73.96 
 
 
871 aa  1207  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  56.29 
 
 
865 aa  941  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  74.32 
 
 
871 aa  1212  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  76.91 
 
 
869 aa  1291  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 
936 aa  1909  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.37002e-05  decreased coverage  2.28409e-09 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  74.08 
 
 
867 aa  1233  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  57.02 
 
 
951 aa  1024  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  89.74 
 
 
856 aa  1494  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.05942e-05  unclonable  2.53026e-10 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  55.72 
 
 
945 aa  1022  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  74.63 
 
 
865 aa  1241  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  83.97 
 
 
935 aa  1556  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  38.94 
 
 
918 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  36.09 
 
 
751 aa  418  1e-115  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  32.39 
 
 
796 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.26 
 
 
796 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  32.86 
 
 
795 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.43 
 
 
795 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.66869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  32.26 
 
 
796 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  33.33 
 
 
795 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.52 
 
 
795 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  4.86649e-05  decreased coverage  2.16935e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  32.05 
 
 
795 aa  363  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  32.05 
 
 
795 aa  363  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  32.05 
 
 
795 aa  363  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.05 
 
 
795 aa  363  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39862e-15 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  32.53 
 
 
812 aa  361  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  6.27944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  32.65 
 
 
794 aa  360  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.11319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  32.01 
 
 
794 aa  359  2e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.74925e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  32.86 
 
 
795 aa  358  2e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  6.56343e-06 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  32.73 
 
 
795 aa  356  9e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  31.88 
 
 
799 aa  347  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  4.00442e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  31.88 
 
 
799 aa  347  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.42513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  32.52 
 
 
799 aa  346  9e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  32.35 
 
 
799 aa  347  9e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.50227e-07  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  31.88 
 
 
799 aa  346  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  31.88 
 
 
799 aa  346  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.18006e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  31.77 
 
 
796 aa  343  6e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  31.75 
 
 
799 aa  343  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  31.63 
 
 
799 aa  343  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  31.63 
 
 
799 aa  342  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  32.43 
 
 
795 aa  332  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  31.44 
 
 
763 aa  227  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  31.78 
 
 
763 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  29.22 
 
 
770 aa  219  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  29.54 
 
 
781 aa  211  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.33 
 
 
1045 aa  210  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  30.62 
 
 
764 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  29.24 
 
 
771 aa  208  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.8 
 
 
927 aa  201  4e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  30.34 
 
 
746 aa  198  4e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  29.12 
 
 
760 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.17 
 
 
744 aa  186  2e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  27.7 
 
 
806 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  24.68 
 
 
924 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  27.14 
 
 
768 aa  169  3e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  25.99 
 
 
811 aa  155  3e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.26 
 
 
747 aa  150  1e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  25.44 
 
 
825 aa  132  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  40.22 
 
 
918 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  32.1 
 
 
566 aa  99.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  43.5 
 
 
1565 aa  98.2  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  44.59 
 
 
1150 aa  95.5  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  36.99 
 
 
1916 aa  89.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  36.73 
 
 
792 aa  89  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  8.52085e-05  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  41.61 
 
 
1667 aa  84  1e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.13 
 
 
816 aa  84  1e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  42.96 
 
 
1667 aa  82.8  3e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  28.3 
 
 
513 aa  82.8  3e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.22 
 
 
1842 aa  82.8  3e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.96 
 
 
1531 aa  82  5e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  26.01 
 
 
480 aa  80.9  1e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  39.13 
 
 
2066 aa  80.9  1e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  37.5 
 
 
1027 aa  80.9  1e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 
3295 aa  79.7  2e-13  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  42.75 
 
 
1094 aa  79.7  3e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.83 
 
 
1095 aa  79.3  3e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  33.89 
 
 
517 aa  79.3  3e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  37.78 
 
 
963 aa  79  4e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  34.32 
 
 
861 aa  79  4e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  40.88 
 
 
910 aa  79  4e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  41.72 
 
 
1732 aa  77.8  9e-13  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  37.27 
 
 
1682 aa  77.4  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  31.47 
 
 
400 aa  77.4  1e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  40.44 
 
 
658 aa  77.8  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  33.56 
 
 
873 aa  77  1e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  5.1412e-06 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  32.14 
 
 
940 aa  77.4  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  41.25 
 
 
3197 aa  77.4  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40.69 
 
 
2272 aa  77.4  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  43.07 
 
 
869 aa  77.8  1e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  38.97 
 
 
713 aa  76.6  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  43.9 
 
 
1300 aa  76.3  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  38.3 
 
 
586 aa  77  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  34.39 
 
 
1236 aa  76.6  2e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  42.34 
 
 
2036 aa  76.6  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  39.86 
 
 
644 aa  76.6  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  37.04 
 
 
859 aa  77  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>