More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4204 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4204  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 599 aa  1243    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6795  UvrD/REP helicase  31.08 
 
 		 571 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.357242 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5176  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 		 573 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1511  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 		 573 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.487565 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4281  UvrD/REP helicase  29.02 
 
 		 606 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6314  UvrD/REP helicase  31.6 
 
 		 579 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5096  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 		 613 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83963 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2848  UvrD/REP helicase  32.15 
 
 		 611 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.385626  normal  0.424075 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 600 aa  186  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3677  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 		 621 aa  170  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0841788  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4315  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 619 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  27.97 
 
 		 728 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  27.52 
 
 		 625 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.36 
 
 		 690 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 668 aa  157  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  27.8 
 
 		 728 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.88 
 
 		 722 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.71 
 
 		 739 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  27.72 
 
 		 726 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  26.98 
 
 		 727 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.16 
 
 		 672 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  27.46 
 
 		 726 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  27 
 
 		 722 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  27.6 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 722 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  28.39 
 
 		 724 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 722 aa  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 663 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  25.11 
 
 		 685 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  26.7 
 
 		 727 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 727 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 722 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 722 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  26.92 
 
 		 721 aa  150  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.71 
 
 		 765 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.62 
 
 		 669 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 731 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  27.08 
 
 		 728 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  26.75 
 
 		 728 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  27.34 
 
 		 723 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  26.75 
 
 		 728 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  27.29 
 
 		 727 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  26.92 
 
 		 722 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  26.96 
 
 		 722 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  26.96 
 
 		 722 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.6 
 
 		 725 aa  147  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  27.23 
 
 		 721 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.68 
 
 		 663 aa  146  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  26.96 
 
 		 722 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  27.4 
 
 		 721 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.04 
 
 		 658 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 		 741 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.29 
 
 		 659 aa  145  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.95 
 
 		 669 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.33 
 
 		 753 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.83 
 
 		 667 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 747 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  26.79 
 
 		 753 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 751 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  28.55 
 
 		 741 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  26.79 
 
 		 751 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 732 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 751 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.65 
 
 		 706 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.29 
 
 		 658 aa  144  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 753 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 751 aa  143  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  26.13 
 
 		 720 aa  143  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 747 aa  143  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.67 
 
 		 662 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  27.05 
 
 		 721 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.96 
 
 		 677 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 769 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 737 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  26.13 
 
 		 720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.57 
 
 		 747 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  26.13 
 
 		 720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  25.98 
 
 		 720 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.93 
 
 		 670 aa  143  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.32 
 
 		 669 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  26.13 
 
 		 720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.32 
 
 		 669 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  25.98 
 
 		 720 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  25.98 
 
 		 720 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  25.98 
 
 		 720 aa  142  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  27.73 
 
 		 723 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  27.75 
 
 		 728 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  25.98 
 
 		 720 aa  142  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.16 
 
 		 669 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  25.98 
 
 		 720 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  26.52 
 
 		 720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  26.52 
 
 		 720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.47 
 
 		 713 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  26.52 
 
 		 720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  26.52 
 
 		 720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  26.52 
 
 		 720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.16 
 
 		 788 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.88 
 
 		 669 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.43 
 
 		 705 aa  140  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>