More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3677 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3677  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 621 aa  1264    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0841788  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4315  UvrD/REP helicase  51.76 
 
 		 619 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6795  UvrD/REP helicase  40.59 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.357242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1511  UvrD/REP helicase  37.91 
 
 		 573 aa  349  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.487565 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5176  UvrD/REP helicase  37.91 
 
 		 573 aa  349  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6314  UvrD/REP helicase  37.68 
 
 		 579 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2848  UvrD/REP helicase  32.13 
 
 		 611 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.385626  normal  0.424075 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5096  UvrD/REP helicase  32.1 
 
 		 613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83963 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  28.71 
 
 		 600 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4281  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 606 aa  190  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.92 
 
 		 659 aa  183  9.000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.53 
 
 		 753 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.22 
 
 		 753 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  30.52 
 
 		 768 aa  170  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.2 
 
 		 747 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 751 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.26 
 
 		 713 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4204  UvrD/REP helicase  27.12 
 
 		 599 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 747 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  27.65 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  27.65 
 
 		 751 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 751 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.23 
 
 		 732 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.5 
 
 		 751 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.5 
 
 		 747 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  26.33 
 
 		 625 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.62 
 
 		 759 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.93 
 
 		 751 aa  164  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.09 
 
 		 751 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3877  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 		 696 aa  163  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.85 
 
 		 662 aa  163  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.3 
 
 		 725 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.53 
 
 		 829 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0060  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.46 
 
 		 696 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.56 
 
 		 730 aa  160  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.56 
 
 		 730 aa  160  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.06 
 
 		 729 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.12 
 
 		 663 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.74 
 
 		 763 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0163  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 695 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.12 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 695 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.64 
 
 		 755 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2905  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 695 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306179  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0150  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 695 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  28.59 
 
 		 721 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  28.59 
 
 		 695 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  31.4 
 
 		 728 aa  157  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 695 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 		 817 aa  157  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  29.33 
 
 		 678 aa  156  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 804 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.71 
 
 		 705 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5490  UvrD/REP helicase  30.67 
 
 		 587 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996527  normal  0.395354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  27.36 
 
 		 749 aa  156  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.59 
 
 		 734 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.22 
 
 		 718 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 826 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.75 
 
 		 787 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 		 789 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  28.42 
 
 		 731 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.33 
 
 		 802 aa  154  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.57 
 
 		 731 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.47 
 
 		 816 aa  154  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  28.42 
 
 		 770 aa  154  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.64 
 
 		 707 aa  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  29.06 
 
 		 790 aa  154  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 748 aa  153  8.999999999999999e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  29.57 
 
 		 685 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.66 
 
 		 677 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3260  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.97 
 
 		 848 aa  153  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  28.97 
 
 		 728 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 706 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 787 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  29.52 
 
 		 723 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  29.52 
 
 		 723 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 678 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 		 728 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.59 
 
 		 677 aa  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0122  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.21 
 
 		 733 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3485  UvrD/REP helicase  28.59 
 
 		 706 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.88 
 
 		 672 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3991  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.73 
 
 		 695 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3919  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.73 
 
 		 695 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0828794  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  27.31 
 
 		 741 aa  151  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.63 
 
 		 670 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.86 
 
 		 766 aa  151  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  29.06 
 
 		 728 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 659 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.32 
 
 		 742 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 679 aa  150  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 677 aa  150  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 		 666 aa  150  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 735 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  29.5 
 
 		 735 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 668 aa  150  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  28.53 
 
 		 744 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.44 
 
 		 670 aa  150  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  28.9 
 
 		 728 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>