More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1732 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
214 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  46.89 
 
 
220 aa  207  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.78 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 
209 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  41.63 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  42.57 
 
 
207 aa  165  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  40.57 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 
208 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
210 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  39.32 
 
 
209 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 
202 aa  159  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 
206 aa  157  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 
205 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
207 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
210 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  39.71 
 
 
207 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 
205 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  36.1 
 
 
213 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 
205 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 
213 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.49 
 
 
211 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.1 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
206 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 
209 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.85 
 
 
214 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  36.97 
 
 
206 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  38.46 
 
 
218 aa  134  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  35.91 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.01 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  36.74 
 
 
215 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  38.79 
 
 
218 aa  131  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  35 
 
 
216 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  36.54 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.38 
 
 
229 aa  129  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.64 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  34.62 
 
 
237 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
217 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  37.63 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  35.98 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.92 
 
 
201 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.47 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  33.64 
 
 
219 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
213 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.95 
 
 
215 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
211 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.95 
 
 
212 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 
210 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 
220 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.24 
 
 
361 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
213 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 
218 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  33.03 
 
 
214 aa  121  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
214 aa  121  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  38.5 
 
 
237 aa  121  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.49 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  35.32 
 
 
237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  35.56 
 
 
231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  34.48 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  33.03 
 
 
214 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  31.4 
 
 
217 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
213 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 
210 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
214 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  34.27 
 
 
217 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 
205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 
238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 
215 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
217 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  33.03 
 
 
241 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
231 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.62 
 
 
230 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
230 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 
201 aa  117  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  33.03 
 
 
214 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>