More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3344 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  63.23 
 
 		 570 aa  723    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  82.87 
 
 		 585 aa  992    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  82.76 
 
 		 586 aa  982    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  82.59 
 
 		 586 aa  982    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  77.91 
 
 		 587 aa  943    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  82.59 
 
 		 586 aa  988    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  80.72 
 
 		 586 aa  977    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  83.28 
 
 		 586 aa  986    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  82.59 
 
 		 586 aa  989    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  60.66 
 
 		 574 aa  660    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  82.76 
 
 		 586 aa  990    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  60.31 
 
 		 574 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  100 
 
 		 586 aa  1188    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  80.34 
 
 		 584 aa  969    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  57.32 
 
 		 589 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  61.34 
 
 		 575 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  62.83 
 
 		 637 aa  722    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  81.08 
 
 		 577 aa  980    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  82.76 
 
 		 586 aa  986    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  82.76 
 
 		 586 aa  986    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  63.44 
 
 		 570 aa  733    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  84.08 
 
 		 586 aa  1017    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  82.76 
 
 		 586 aa  990    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  57.17 
 
 		 574 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  55.6 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  52.71 
 
 		 582 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  52.91 
 
 		 612 aa  599  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  50.7 
 
 		 569 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  52.04 
 
 		 585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  49.48 
 
 		 578 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  48.57 
 
 		 577 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  41.86 
 
 		 558 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.68 
 
 		 553 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.68 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.3 
 
 		 558 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.1 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.49 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.81 
 
 		 573 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.36 
 
 		 871 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 591 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.93 
 
 		 553 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.99 
 
 		 568 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.08 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.96 
 
 		 568 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  39.75 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.83 
 
 		 568 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.32 
 
 		 568 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.18 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.9 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.12 
 
 		 568 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.5 
 
 		 563 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.32 
 
 		 568 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.08 
 
 		 599 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 568 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  38.83 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 564 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.72 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.12 
 
 		 568 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.46 
 
 		 561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.18 
 
 		 557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.79 
 
 		 577 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.86 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.79 
 
 		 566 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  39.09 
 
 		 577 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.25 
 
 		 556 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 555 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 559 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.64 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 571 aa  402  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  38.23 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  39.01 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 564 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.18 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  40 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  42.2 
 
 		 521 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 571 aa  389  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.46 
 
 		 565 aa  389  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 586 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.85 
 
 		 787 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  37.39 
 
 		 558 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.23 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  39.2 
 
 		 573 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  39.75 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  39.93 
 
 		 575 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  39.01 
 
 		 569 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.18 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.49 
 
 		 885 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  39.12 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.46 
 
 		 514 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.57 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  38.6 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  41.76 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  41.28 
 
 		 550 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>