More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3502 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  100 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 237 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  33.75 
 
 		 417 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  33.47 
 
 		 417 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.76 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  29.13 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  32 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  31.9 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  32.33 
 
 		 234 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  31.39 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  33.18 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 347 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 		 276 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243051  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  27.04 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 279 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  34.21 
 
 		 304 aa  92.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  27.04 
 
 		 237 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  28.45 
 
 		 413 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 277 aa  91.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  28.33 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  25.33 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 285 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 		 234 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 285 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.67 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 		 294 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  29.56 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 296 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 305 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 282 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  30.05 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  30.05 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  30.05 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 283 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  29.26 
 
 		 282 aa  85.5  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 418 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 276 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  28.76 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  27.19 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.55 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.55 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  31.73 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>