More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1336 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 418 aa  855    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  50.96 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  49.88 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  51.2 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 238 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 237 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 243 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 		 245 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 232 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 		 233 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.09 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  31.22 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 237 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  25.29 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  31.31 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 239 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 234 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.71 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  28.07 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  28.07 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  28.07 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  28.07 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  28.07 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 237 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  27.83 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 		 243 aa  67  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  27.78 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 239 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 235 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  25.94 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 671 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.72 
 
 		 247 aa  62.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 268 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.47 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 		 239 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 		 239 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.14 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  29.26 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.79 
 
 		 295 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.66 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  28.57 
 
 		 267 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00216  conserved hypothetical protein  32.89 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110281  normal  0.352442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.64 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>