53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2046 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  100 
 
 		 1369 aa  2777    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  22.85 
 
 		 6109 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  34.66 
 
 		 722 aa  98.6  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  33.78 
 
 		 722 aa  94  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  33.51 
 
 		 792 aa  86.7  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  34.7 
 
 		 2074 aa  78.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1987 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  34.4 
 
 		 440 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  38.46 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.5 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  41.23 
 
 		 852 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  40.18 
 
 		 1707 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.93 
 
 		 427 aa  60.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.6 
 
 		 1755 aa  59.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.37 
 
 		 447 aa  57.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  26.14 
 
 		 3586 aa  57.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  35.59 
 
 		 671 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  27.23 
 
 		 14609 aa  54.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 490 aa  55.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.91 
 
 		 420 aa  54.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.5 
 
 		 320 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 458 aa  53.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  29.95 
 
 		 637 aa  53.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 319 aa  53.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  30.93 
 
 		 727 aa  53.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 374 aa  52  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  35.17 
 
 		 322 aa  51.6  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  36.59 
 
 		 823 aa  51.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.77 
 
 		 412 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 		 401 aa  51.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  37.84 
 
 		 780 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 314 aa  50.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  33.54 
 
 		 1335 aa  49.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1804 aa  49.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.23 
 
 		 543 aa  48.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 487 aa  48.5  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.23 
 
 		 544 aa  48.5  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.23 
 
 		 542 aa  48.5  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 623 aa  48.5  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  34.72 
 
 		 1831 aa  48.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.22 
 
 		 456 aa  48.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  41.89 
 
 		 381 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  31.4 
 
 		 1394 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.49 
 
 		 1332 aa  47.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  42.42 
 
 		 1918 aa  47  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 380 aa  46.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  36.57 
 
 		 386 aa  46.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  37.74 
 
 		 290 aa  46.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  44.94 
 
 		 483 aa  46.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.98 
 
 		 913 aa  45.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  26.56 
 
 		 1219 aa  45.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 		 386 aa  45.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  37.36 
 
 		 366 aa  45.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>