More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0132 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  50.49 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  56.29 
 
 		 202 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  45.24 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  41.92 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  42.19 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  41.38 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  45.63 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  42.94 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  40.91 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  39.5 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  41.75 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  40.36 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  42.17 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  40.1 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.05 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  40.59 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  38.35 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  43.71 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  42.51 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  38.3 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  36.09 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  32.31 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  32.31 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  34.3 
 
 		 229 aa  94.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  36.9 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  37.06 
 
 		 268 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  32.32 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  37.95 
 
 		 268 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 393 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31.16 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  39.01 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  33.51 
 
 		 317 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  32.43 
 
 		 373 aa  85.1  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.76 
 
 		 243 aa  84.7  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  30 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.28 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  31.86 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 387 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 392 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 387 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 392 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  40.71 
 
 		 282 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  33.89 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  33.14 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.27 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.27 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.27 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  33.89 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.27 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  28.8 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  29.59 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.37 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  41.57 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.06 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.06 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.06 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.06 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.06 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.66 
 
 		 386 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  32.78 
 
 		 393 aa  75.1  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.72 
 
 		 277 aa  75.1  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  31.75 
 
 		 379 aa  75.1  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 282 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.97 
 
 		 277 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  31.52 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  35.59 
 
 		 360 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  47.89 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.49 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.49 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.49 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  32.49 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  30.52 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>