More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3760 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
301 aa  610  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.25 
 
 
301 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  62.79 
 
 
292 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  57 
 
 
301 aa  348  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  57 
 
 
301 aa  348  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  57 
 
 
301 aa  348  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.08 
 
 
301 aa  348  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  58 
 
 
301 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  57 
 
 
301 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  56.44 
 
 
304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  58.8 
 
 
292 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  61.13 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
301 aa  326  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.53 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.33 
 
 
301 aa  308  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
295 aa  291  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 
310 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.8 
 
 
311 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  52.14 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.67 
 
 
309 aa  271  7e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
351 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
298 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  46.5 
 
 
291 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
332 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
316 aa  218  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
300 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 
333 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.389719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.81 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.57 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.43 
 
 
306 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
307 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.61 
 
 
307 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.61 
 
 
307 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
309 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  46.64 
 
 
903 aa  187  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.06 
 
 
306 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
306 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13536  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.2 
 
 
317 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.721751  hitchhiker  0.00000286322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
303 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
309 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  45.45 
 
 
303 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  45.45 
 
 
303 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
304 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
306 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.91 
 
 
301 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
292 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  36.79 
 
 
305 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
303 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
308 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  41.76 
 
 
901 aa  179  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.263864  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.38 
 
 
305 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  40 
 
 
350 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  37.63 
 
 
304 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
303 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
913 aa  175  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
303 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  39.02 
 
 
286 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
710 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  36.39 
 
 
292 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.72 
 
 
304 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
287 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
317 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
301 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
287 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
301 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
287 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
288 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
304 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
287 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
306 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
304 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
306 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
306 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
305 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
304 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
324 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
304 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
313 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  38.75 
 
 
893 aa  159  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
324 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
324 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
324 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
300 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
300 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
303 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
313 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>