80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2423 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 638 aa  1298    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  58.65 
 
 		 581 aa  695    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  38.78 
 
 		 690 aa  463  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.53 
 
 		 704 aa  436  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  33.71 
 
 		 704 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.23 
 
 		 487 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.78 
 
 		 698 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.52 
 
 		 709 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.7 
 
 		 688 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  37.72 
 
 		 932 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  37.92 
 
 		 750 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.14 
 
 		 687 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  35.34 
 
 		 606 aa  347  4e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  41.45 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  35.94 
 
 		 470 aa  304  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  35.71 
 
 		 460 aa  267  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  38.14 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  35.49 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  38.72 
 
 		 410 aa  263  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  22.64 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  22.2 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.6 
 
 		 467 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  28.53 
 
 		 435 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  27.86 
 
 		 674 aa  106  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  27.01 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  30.56 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  28.62 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  28.19 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  27.87 
 
 		 445 aa  100  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  28.12 
 
 		 478 aa  99.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  29.63 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  28.95 
 
 		 340 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  22.9 
 
 		 538 aa  95.9  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  26.51 
 
 		 452 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  26.95 
 
 		 440 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  28.82 
 
 		 596 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  34.39 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  26.46 
 
 		 474 aa  90.5  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  26.94 
 
 		 431 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  27.27 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  25.59 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  24.27 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  24.66 
 
 		 627 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  26.07 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  24.48 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  24.92 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  35.59 
 
 		 711 aa  74.3  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  23.72 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  26.78 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  27.88 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  30.5 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.5 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  25.95 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  25.75 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  21.5 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  43.59 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.23 
 
 		 1289 aa  60.8  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  23.34 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  25.8 
 
 		 490 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  26.1 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  39.05 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  25.26 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  40 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  23.48 
 
 		 532 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  21.72 
 
 		 464 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  32.32 
 
 		 212 aa  52.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  30.08 
 
 		 495 aa  51.2  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  24.64 
 
 		 466 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  26.03 
 
 		 516 aa  50.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  29.03 
 
 		 537 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  24.07 
 
 		 534 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  28.83 
 
 		 584 aa  47.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  27.93 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  27.03 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  25 
 
 		 473 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  22.58 
 
 		 515 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.88 
 
 		 1264 aa  44.3  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.58 
 
 		 674 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 752 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>