243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0238 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  100 
 
 		 436 aa  875    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  60.47 
 
 		 441 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  41.69 
 
 		 424 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  38.07 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  36.49 
 
 		 432 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  29.93 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  28.93 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  28.86 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  29.24 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  28.92 
 
 		 428 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  27.93 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  28.64 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  26.88 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  26.33 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  26.67 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.53 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  28.87 
 
 		 416 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  29.47 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  27.02 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  29.5 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  28.5 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  26.9 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  25.65 
 
 		 407 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  28.5 
 
 		 382 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  25.42 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  26.97 
 
 		 412 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  27.31 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  25.69 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  26.81 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  27.46 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  30.18 
 
 		 372 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  29.55 
 
 		 402 aa  86.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  31.6 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  29.23 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  27.14 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  29.92 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  26.65 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  29.13 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  27.09 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  26.29 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  32.39 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  25.59 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  25.87 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  25.87 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  27.49 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.38 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  28.28 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  25.67 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  33.96 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.87 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.87 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  29.25 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.1 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  24.82 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.69 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  26.99 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  27.04 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  31.23 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.72 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  26.9 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  25.6 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  31.18 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  27.76 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  30.95 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  26.53 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  25.87 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  29.17 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  30.6 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  28.75 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  30.45 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  29.95 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  25.1 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  26.69 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  27.16 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  28.15 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  29.63 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  25.52 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  30 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  29.36 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.73 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  31.75 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  27.78 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  24.07 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  30.05 
 
 		 473 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  28.48 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  29.17 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  29.51 
 
 		 473 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  30.17 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  29.58 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  23.65 
 
 		 372 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.42 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  29.56 
 
 		 473 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  27.71 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  29.06 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.88 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  29.81 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  29.89 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>