More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2671 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  67.18 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  59 
 
 		 263 aa  321  8e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  54.55 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  54.2 
 
 		 289 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  53.03 
 
 		 267 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  54.2 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  52.61 
 
 		 272 aa  285  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  53.1 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  52.83 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  51.55 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  52.83 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  52.33 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  52.71 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  51.33 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  51.55 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  51.16 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  49.24 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  51.91 
 
 		 268 aa  271  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  50.78 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  48.13 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  51.91 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  48.5 
 
 		 269 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  49.43 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  50.57 
 
 		 270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  48.52 
 
 		 290 aa  258  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  49.24 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  48.87 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  50 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  48.5 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 270 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  48.47 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  48.48 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 268 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  45.08 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  38.72 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  39.23 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  37.59 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  34.31 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  34.31 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  34.2 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  36.23 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 264 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  36.6 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  36.54 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  34.7 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  36.6 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  35.34 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  36.76 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  35.71 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  36.74 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.08 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  35.53 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  34.94 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  35.06 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  35.53 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  36.03 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  35.96 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  34.7 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  32.71 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  33.59 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  35.77 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  32.59 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  36.98 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  34.46 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  32.96 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.02 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  33.96 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  34.36 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  34.7 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  32.96 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  34.81 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  35.07 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  36.06 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  34.7 
 
 		 264 aa  131  9e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  33.97 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  38.11 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  31.73 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  35.32 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  38.11 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  32.72 
 
 		 288 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  31.34 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.2 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  34.34 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  36.3 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  35.47 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  35.5 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  29.81 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>