More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0065 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  43.58 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  40.54 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  42.97 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  39.15 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  36.82 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  37.21 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  41.34 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  40.7 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  36.57 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  33.84 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  37.21 
 
 		 277 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  37.69 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  40.7 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  38.61 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  39.53 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  36.92 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  39.38 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  39.37 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  36.15 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.61 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  39.29 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  39.38 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  39.15 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  37.25 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  38.87 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  37.6 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  38.17 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  38.31 
 
 		 288 aa  168  9e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  39.38 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  41.41 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  37.85 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.45 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  39 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  39.53 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  41.41 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  39 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  39 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  35.88 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  39.06 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  36.08 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.17 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  37.02 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  37.55 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  39.04 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  39.04 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  39.16 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  41.63 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  36.61 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  39.23 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  38.61 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  38.22 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  37.3 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  38.22 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.18 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  35.16 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  35.23 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  37.5 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  36.72 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1451  exonuclease III  36.06 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000170984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  39.62 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  33.96 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  39.32 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  38.46 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003967  exodeoxyribonuclease III  36.57 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000103891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  38.1 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  34.77 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  35.25 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  37.4 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>