More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0444 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  100 
 
 
248 aa  497  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  56.85 
 
 
247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  43.9 
 
 
250 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  45.12 
 
 
250 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
249 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
248 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  47.62 
 
 
233 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  42.17 
 
 
248 aa  191  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  43.95 
 
 
250 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  44.35 
 
 
250 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  43.95 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  43.95 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  43.95 
 
 
250 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  43.95 
 
 
250 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  43.95 
 
 
250 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  43.95 
 
 
250 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  43.55 
 
 
250 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  39.04 
 
 
253 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
253 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  38.8 
 
 
252 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  40.64 
 
 
229 aa  155  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 
247 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  37.77 
 
 
236 aa  145  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  35.29 
 
 
245 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 
248 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  37.83 
 
 
245 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.81 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  35.96 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 
253 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  34.93 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  34.78 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 
256 aa  129  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  38.6 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.12 
 
 
266 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.52 
 
 
253 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  36.52 
 
 
251 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
266 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 
253 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
256 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  34.68 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.01 
 
 
253 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 
251 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
253 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
254 aa  118  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  31.85 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
254 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
251 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
251 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  34.06 
 
 
252 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
251 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
254 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  32.65 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  40.19 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  33.62 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  34.38 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  33.62 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
251 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  30.93 
 
 
252 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 
252 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl179  fru repressor  36.05 
 
 
230 aa  111  9e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
274 aa  111  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  32.89 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 
290 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  33.86 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.89 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  36.17 
 
 
267 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
257 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  33.49 
 
 
254 aa  108  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.33 
 
 
257 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  33.8 
 
 
254 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 
263 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 
269 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
257 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
266 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
267 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
258 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
268 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>