More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2380 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  100 
 
 		 458 aa  903    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  44.92 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0265  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0258  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0586  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0582  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 495 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.19645  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 495 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  41.26 
 
 		 491 aa  342  9e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 516 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 514 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.37 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.1 
 
 		 480 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  24.61 
 
 		 534 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  26.78 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.48 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.48 
 
 		 484 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 574 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.22 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.92 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.36 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.8 
 
 		 529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.28 
 
 		 524 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 		 478 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 512 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.12 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2752  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  29.38 
 
 		 582 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 480 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 504 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 512 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.64 
 
 		 485 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 		 498 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  28.93 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 553 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  26.69 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.32 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.53 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.53 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.53 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.53 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.53 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.53 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.63 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.43 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.44 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.71 
 
 		 458 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 505 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.71 
 
 		 493 aa  123  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 516 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.86 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 		 508 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.58 
 
 		 487 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3656  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 515 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00788445  normal  0.022371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 482 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.56 
 
 		 534 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 486 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 488 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 488 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
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CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.13 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.82 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  25.82 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
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NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.41 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.66 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  25.82 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.39 
 
 		 607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
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NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.25 
 
 		 502 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
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NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
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NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.13 
 
 		 511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
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