More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1128 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1128  DNA primase  100 
 
 		 598 aa  1227    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  68.97 
 
 		 605 aa  870    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  68.97 
 
 		 605 aa  870    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.68 
 
 		 601 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.06 
 
 		 598 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.23 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.06 
 
 		 598 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.06 
 
 		 598 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.06 
 
 		 598 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.06 
 
 		 598 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.82 
 
 		 600 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.06 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.06 
 
 		 598 aa  412  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.79 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  37.5 
 
 		 571 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.54 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  33.88 
 
 		 621 aa  353  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.25 
 
 		 599 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.06 
 
 		 626 aa  312  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 604 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  40.71 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  32.41 
 
 		 606 aa  307  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  33.61 
 
 		 599 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  30.38 
 
 		 601 aa  306  9.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  39.24 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.35 
 
 		 613 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  33.27 
 
 		 619 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  38.23 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  33.61 
 
 		 604 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  35.55 
 
 		 640 aa  294  3e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  33.08 
 
 		 596 aa  294  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  31.07 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.89 
 
 		 655 aa  290  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35 
 
 		 651 aa  290  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  32.61 
 
 		 673 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.43 
 
 		 652 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  30.15 
 
 		 595 aa  287  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.32 
 
 		 600 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  38.38 
 
 		 636 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.42 
 
 		 660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.17 
 
 		 638 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.59 
 
 		 660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.42 
 
 		 660 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.14 
 
 		 614 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.19 
 
 		 660 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  33.99 
 
 		 663 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.56 
 
 		 605 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.51 
 
 		 663 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  35.96 
 
 		 660 aa  280  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  40.91 
 
 		 578 aa  279  9e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  34.64 
 
 		 653 aa  279  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  37.21 
 
 		 662 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  34.68 
 
 		 703 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.93 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  34.51 
 
 		 664 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  33.56 
 
 		 605 aa  278  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  29.13 
 
 		 601 aa  277  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  35.81 
 
 		 660 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  34.76 
 
 		 674 aa  276  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  40.68 
 
 		 637 aa  276  8e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  39.77 
 
 		 564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  38.63 
 
 		 675 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.77 
 
 		 632 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.72 
 
 		 592 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  37.36 
 
 		 587 aa  273  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  39.06 
 
 		 646 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  40 
 
 		 595 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  39.06 
 
 		 646 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  34.5 
 
 		 676 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  38.16 
 
 		 640 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.9 
 
 		 652 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  36.23 
 
 		 577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  30.2 
 
 		 617 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.34 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.73 
 
 		 595 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  39.28 
 
 		 694 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  29.93 
 
 		 598 aa  267  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  35.95 
 
 		 656 aa  267  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  28.6 
 
 		 583 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  34.29 
 
 		 655 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  37.5 
 
 		 651 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.44 
 
 		 584 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  32.65 
 
 		 704 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  29.21 
 
 		 582 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  38.27 
 
 		 613 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  35.02 
 
 		 636 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  39.2 
 
 		 630 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  32.43 
 
 		 657 aa  263  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  33.33 
 
 		 656 aa  263  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  36.97 
 
 		 632 aa  262  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  37.08 
 
 		 611 aa  261  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  31.83 
 
 		 587 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  35.29 
 
 		 677 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  28.35 
 
 		 595 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  29.87 
 
 		 686 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  36.1 
 
 		 553 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  30.88 
 
 		 578 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  28.99 
 
 		 583 aa  257  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  36.1 
 
 		 572 aa  257  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  36.07 
 
 		 660 aa  256  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>