More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0863 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  49.56 
 
 		 892 aa  863    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 858 aa  661    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 871 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  43.76 
 
 		 867 aa  746    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 869 aa  712    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 873 aa  1812    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 868 aa  689    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  49.78 
 
 		 892 aa  861    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  44.17 
 
 		 858 aa  746    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  38.75 
 
 		 872 aa  643    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.92 
 
 		 872 aa  698    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 		 892 aa  867    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 		 890 aa  868    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  49.78 
 
 		 894 aa  868    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  49.33 
 
 		 892 aa  861    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39.22 
 
 		 881 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  53.52 
 
 		 860 aa  929    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 891 aa  669    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 858 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  42.67 
 
 		 900 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  80.89 
 
 		 872 aa  1467    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.67 
 
 		 858 aa  673    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  49.28 
 
 		 890 aa  863    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  46.7 
 
 		 870 aa  813    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 		 870 aa  723    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  42.83 
 
 		 882 aa  711    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.57 
 
 		 872 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 		 892 aa  867    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  49.89 
 
 		 890 aa  867    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.28 
 
 		 869 aa  736    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  45.66 
 
 		 863 aa  728    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 		 892 aa  867    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  50.44 
 
 		 895 aa  890    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  47.24 
 
 		 850 aa  712    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  46.45 
 
 		 896 aa  767    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 837 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 		 932 aa  756    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  43.13 
 
 		 872 aa  729    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  45.71 
 
 		 863 aa  730    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 887 aa  714    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.98 
 
 		 868 aa  785    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 		 897 aa  733    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 882 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 865 aa  714    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  42.01 
 
 		 853 aa  681    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 870 aa  716    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  39.49 
 
 		 868 aa  673    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  46.27 
 
 		 873 aa  790    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  80.89 
 
 		 872 aa  1467    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  47.64 
 
 		 910 aa  785    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  47.51 
 
 		 910 aa  784    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 896 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  50.61 
 
 		 903 aa  907    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  43.91 
 
 		 859 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 823 aa  647    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  46.01 
 
 		 840 aa  770    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  48.53 
 
 		 857 aa  806    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  46.29 
 
 		 854 aa  789    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 		 852 aa  789    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  50.17 
 
 		 881 aa  891    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 857 aa  666    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 889 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 848 aa  656    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 		 927 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 		 887 aa  628  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 		 871 aa  627  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 		 862 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 		 880 aa  622  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 873 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 859 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  37.02 
 
 		 910 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.24 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  37.85 
 
 		 871 aa  619  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.92 
 
 		 862 aa  621  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  37.87 
 
 		 872 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 859 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 		 904 aa  618  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  37.45 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 859 aa  616  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 871 aa  617  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 852 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 878 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 861 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 898 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 872 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  36.63 
 
 		 905 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 856 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 882 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 858 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 856 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 854 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 		 883 aa  615  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 874 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 855 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 		 856 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 856 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 		 851 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.49 
 
 		 856 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 872 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 868 aa  607  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>