296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2156 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  100 
 
 
369 aa  750    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  69.72 
 
 
366 aa  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  54.14 
 
 
359 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  48.14 
 
 
375 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  47.73 
 
 
375 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  47.73 
 
 
375 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  47.73 
 
 
375 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  48.37 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  48.1 
 
 
375 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  47.73 
 
 
375 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  47.73 
 
 
375 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  47.73 
 
 
375 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  46.76 
 
 
374 aa  338  7e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  48.1 
 
 
375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  47.81 
 
 
373 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  48.53 
 
 
374 aa  332  4e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  45.53 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  43.9 
 
 
372 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  47.98 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  44.99 
 
 
371 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  44.84 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  44.84 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  44.65 
 
 
374 aa  311  1e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  40.22 
 
 
361 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  40.22 
 
 
361 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.94 
 
 
372 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.05 
 
 
371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  39.73 
 
 
375 aa  269  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.43 
 
 
386 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.98 
 
 
360 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  42.12 
 
 
369 aa  255  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.6 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  37.37 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.6 
 
 
376 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  38.84 
 
 
371 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  38.34 
 
 
376 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  33.67 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  39.5 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  34.27 
 
 
392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  37.63 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  34.15 
 
 
362 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  33.52 
 
 
368 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.72 
 
 
382 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  35.15 
 
 
364 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  39.89 
 
 
377 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.95 
 
 
377 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  35.23 
 
 
364 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.36 
 
 
359 aa  202  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  38.55 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.96 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.53 
 
 
360 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  35.13 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  34.32 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  32.93 
 
 
394 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.48 
 
 
397 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  30.75 
 
 
377 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  32.72 
 
 
377 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  31.3 
 
 
376 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  30.18 
 
 
380 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.25 
 
 
374 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  30.18 
 
 
380 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  31.79 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  30.18 
 
 
380 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  33.61 
 
 
366 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.39 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.65 
 
 
362 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  31.15 
 
 
401 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  38.46 
 
 
380 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  38.46 
 
 
380 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  30.93 
 
 
399 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.32 
 
 
390 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  29.38 
 
 
386 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  30.83 
 
 
371 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  33.51 
 
 
365 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  29.92 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.33 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.3 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  31.43 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  30.05 
 
 
365 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  28.21 
 
 
390 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  29.92 
 
 
385 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  33.52 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.95 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
420 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.69 
 
 
398 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.9 
 
 
372 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.27 
 
 
397 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  35.65 
 
 
348 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  32.69 
 
 
363 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  31.81 
 
 
360 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  35.65 
 
 
348 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  29.2 
 
 
414 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  31.64 
 
 
367 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  28.88 
 
 
390 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  30.64 
 
 
377 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  30.34 
 
 
387 aa  175  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  33.06 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.62 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  32.67 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.64 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>