More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0073 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
178 aa  353  6e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  87.64 
 
 
178 aa  312  2e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  74.16 
 
 
178 aa  261  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 
179 aa  212  2e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  60.67 
 
 
178 aa  213  2e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 
179 aa  212  2e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 
178 aa  211  6e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  210  8e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.19907e-09  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.01317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  209  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.12924e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  209  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.65093e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  209  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.15024e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  209  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.62457e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 
178 aa  209  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  209  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  209  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.64591e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  58.19 
 
 
179 aa  208  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  59.32 
 
 
177 aa  207  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  207  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.05529e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 
178 aa  207  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.68089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
178 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  57.95 
 
 
180 aa  202  2e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
178 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 
178 aa  201  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.08957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
178 aa  199  1e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  55.06 
 
 
180 aa  198  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  1.69605e-05 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56.18 
 
 
181 aa  194  4e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  1.13192e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  57.31 
 
 
183 aa  194  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  54.24 
 
 
177 aa  193  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  53.98 
 
 
182 aa  192  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  56.18 
 
 
179 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  54.49 
 
 
180 aa  188  3e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.79167e-09  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  55.93 
 
 
179 aa  188  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  50.81 
 
 
187 aa  187  6e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 
182 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.64662e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  187  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  52.91 
 
 
183 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  55.23 
 
 
183 aa  185  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.53841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
178 aa  185  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 
180 aa  184  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  53.14 
 
 
177 aa  183  1e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 
179 aa  183  1e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.76648e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  56.18 
 
 
179 aa  182  2e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
178 aa  182  2e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 
178 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
176 aa  179  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.99249e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 
180 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 
177 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
178 aa  178  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  48.88 
 
 
178 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  2.82439e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  53.01 
 
 
184 aa  178  5e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  53.01 
 
 
184 aa  178  5e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.36844e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  50.56 
 
 
178 aa  177  6e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  52.81 
 
 
178 aa  177  6e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  50.88 
 
 
182 aa  177  6e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.89089e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 
177 aa  177  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  3.13624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  177  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  52.2 
 
 
184 aa  177  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 
178 aa  177  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  50.81 
 
 
187 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
180 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  54.97 
 
 
184 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  51.41 
 
 
177 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50 
 
 
178 aa  175  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
180 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  51.93 
 
 
179 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24387e-10 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  175  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
179 aa  175  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  175  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.03619e-11  hitchhiker  3.81043e-08 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  49.72 
 
 
179 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  51.18 
 
 
182 aa  174  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  6.72522e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
180 aa  174  5e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 
179 aa  174  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  9.53175e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  174  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  1.04709e-06  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  50.88 
 
 
182 aa  174  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  51.14 
 
 
178 aa  174  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  5.83709e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  173  1e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 
179 aa  173  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  51.65 
 
 
185 aa  172  2e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  6.53626e-05  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  172  3e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 
180 aa  172  3e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  48.6 
 
 
179 aa  172  3e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  49.7 
 
 
184 aa  171  4e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
179 aa  171  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  5.14634e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  171  6e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  171  6e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
180 aa  171  7e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 
179 aa  170  8e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 
180 aa  170  8e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  170  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  170  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 
177 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  50.9 
 
 
185 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  51.38 
 
 
179 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 
179 aa  169  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  8.70536e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>