More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0058 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
208 aa  415  1e-115  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  94.71 
 
 
208 aa  400  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.2853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  75.71 
 
 
210 aa  332  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.19433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  73.81 
 
 
210 aa  326  2e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  73.81 
 
 
210 aa  326  2e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  72.86 
 
 
210 aa  323  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.68091e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  72.86 
 
 
210 aa  323  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.41135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  72.86 
 
 
210 aa  323  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  72.86 
 
 
210 aa  323  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.67077e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  72.86 
 
 
210 aa  323  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.05997e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  72.86 
 
 
210 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.86131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  72.86 
 
 
210 aa  323  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.51418e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  72.86 
 
 
210 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.46604e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  72.6 
 
 
211 aa  312  2e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  72 
 
 
213 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  71.9 
 
 
209 aa  296  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.00637e-07  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  67.96 
 
 
228 aa  288  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  66.35 
 
 
219 aa  283  2e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.63613e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  62.5 
 
 
220 aa  273  1e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  64.39 
 
 
211 aa  271  5e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.99657e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
209 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  63.43 
 
 
220 aa  269  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.23614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  62.5 
 
 
220 aa  265  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.05261e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  63.16 
 
 
247 aa  263  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.58145e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  61.72 
 
 
210 aa  255  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  58.85 
 
 
209 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  58.85 
 
 
209 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  55.61 
 
 
212 aa  244  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.41734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  59.62 
 
 
210 aa  243  2e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  59.62 
 
 
209 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  60.29 
 
 
210 aa  241  4e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  58.29 
 
 
211 aa  241  4e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  58.65 
 
 
209 aa  241  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  58.17 
 
 
211 aa  240  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  57.35 
 
 
223 aa  237  8e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  57.84 
 
 
238 aa  236  1e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.49955e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  57.49 
 
 
209 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.70606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  55.07 
 
 
213 aa  232  2e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 
209 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  54.98 
 
 
211 aa  224  5e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 
212 aa  218  4e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.33446e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  57.08 
 
 
212 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  4.77342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 
210 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.81863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 
218 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 
218 aa  211  5e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 
218 aa  211  5e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 
212 aa  211  5e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  54.95 
 
 
205 aa  211  6e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
218 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 
211 aa  210  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.74639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
218 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
210 aa  207  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.31463e-05  hitchhiker  3.31617e-13 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
210 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
210 aa  205  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 
213 aa  205  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.29954e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  204  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 
212 aa  203  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.09154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  52.53 
 
 
209 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 
206 aa  202  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
212 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  1.67398e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  52.66 
 
 
204 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 
272 aa  201  7e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  54.72 
 
 
212 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  1.5584e-06  hitchhiker  7.58128e-06 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 
207 aa  201  1e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 
219 aa  200  1e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  54.23 
 
 
205 aa  199  2e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  49.52 
 
 
219 aa  199  2e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 
220 aa  199  2e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 
214 aa  199  2e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.7151e-11  hitchhiker  1.66028e-07 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
218 aa  199  4e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  52.13 
 
 
212 aa  198  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.8687e-07  unclonable  4.91767e-12 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  47.96 
 
 
227 aa  198  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  51.46 
 
 
206 aa  198  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  52.15 
 
 
216 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  50.24 
 
 
226 aa  197  8e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.72 
 
 
216 aa  197  8e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 
209 aa  197  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  50.99 
 
 
205 aa  197  1e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  51.67 
 
 
222 aa  197  1e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  54.59 
 
 
209 aa  197  1e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
219 aa  196  2e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 
205 aa  195  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  51.18 
 
 
219 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 
212 aa  195  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 
205 aa  195  4e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  5.30687e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  52.11 
 
 
214 aa  195  4e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  6.58885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  52.61 
 
 
212 aa  195  4e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 
209 aa  195  4e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  52.15 
 
 
213 aa  195  5e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.28 
 
 
209 aa  195  5e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 
211 aa  195  5e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
218 aa  195  5e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1574  ribosomal protein L3  53.37 
 
 
209 aa  194  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.99368e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 
209 aa  194  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 
213 aa  194  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  50 
 
 
215 aa  193  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 
206 aa  193  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  48.82 
 
 
211 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 
206 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>