More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0971 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0749  rare lipoprotein A  57.81 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0313  rare lipoprotein A  57.52 
 
 		 121 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  51.92 
 
 		 360 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  51.92 
 
 		 360 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  56.63 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  58.02 
 
 		 342 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  55.42 
 
 		 121 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 367 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  58.95 
 
 		 238 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  50.5 
 
 		 238 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  56.63 
 
 		 160 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  50.45 
 
 		 214 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  46.02 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  59.74 
 
 		 168 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  55.29 
 
 		 138 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 322 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  46.02 
 
 		 261 aa  96.7  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  54.76 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  55.42 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  47.17 
 
 		 339 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  58.82 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  50 
 
 		 119 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 122 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.41 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.41 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  53.41 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.41 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  41.94 
 
 		 124 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  56.63 
 
 		 159 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 122 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  53.66 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  55.42 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.41 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  53.41 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  53.41 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  49.52 
 
 		 125 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 371 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 279 aa  95.5  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  48.04 
 
 		 169 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  43.1 
 
 		 124 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  52.04 
 
 		 227 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 323 aa  94.7  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  60.76 
 
 		 94 aa  94.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  47.17 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  54.22 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  47.17 
 
 		 375 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 142 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  51.49 
 
 		 266 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 275 aa  93.2  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 358 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  54.65 
 
 		 125 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 275 aa  93.2  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  47.32 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  46.81 
 
 		 115 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 108 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  52.27 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  46.81 
 
 		 115 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  42.24 
 
 		 124 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  51.69 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  39.38 
 
 		 270 aa  92.8  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 134 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  46.23 
 
 		 370 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 114 aa  92.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 142 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  42.24 
 
 		 124 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  46.81 
 
 		 115 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  51.76 
 
 		 303 aa  91.3  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  50.59 
 
 		 122 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2055  rare lipoprotein A  51.06 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  55 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  50 
 
 		 120 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  49.4 
 
 		 110 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  47.12 
 
 		 360 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  42.24 
 
 		 155 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  54.22 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  53.75 
 
 		 157 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  50 
 
 		 335 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  47.12 
 
 		 360 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  47.12 
 
 		 360 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  52.44 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  56.32 
 
 		 391 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  51.14 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  59.49 
 
 		 381 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  52.17 
 
 		 153 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  55.68 
 
 		 285 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>